ководді дельти знаходяться основні нерестовища байкальської омуля.
Невелика частина забруднення води оз. Байкал припадає на Читинскую область. Забруднення надходить від металургійних і деревообробних підприємств м Петровськ-Забайкальський та кількох підприємств в Хілокском і Красночікойском районах. Забруднюючі речовини надходять в оз. Байкал по р. Чикой і р. Хилок, які є головними притоками Селенги. Ці підприємства щорічно скидають сумарно понад 20 млн. М 3 стічних вод, у тому числі десятки тисяч тонн зважених речовин і органіки.
Основні джерела забруднення р. Селенги знаходяться в Республіці Бурятія. Тут розташовані великі промислові центри, такі як м Улан-Уде та м Селенгинск. В Улан-Уде - міські очисні споруди дають 35% всіх скидів у Селенгу. У 2000 р проби води, відібрані в р. Селенга в безпосередній близькості від м Улан-Уде містили забруднюючі речовини в концентраціях, кілька разів перевищують ГДК. Так, було відмічено перевищення допустимих концентрацій по фенолу в 2-8 разів і ГПК (хімічне споживання кисню) в 2 рази. Також було відзначено перевищення ГДК по іонів міді, залізу, БПК, нітратів, цинку і нафтопродуктам, за змістом фосфору і нітратів.
У 1973 р поряд з м Селенгинск в 60 км від оз. Байкал був побудований Селенгинский целюлозно-картонний комбінат (СЦКК). У 1991 р на ньому була введена система замкнутого водообігу. За заявами підприємства скидання стічних вод у р. Селенгу повністю припинений. Однак комбінат продовжує забруднювати атмосферне повітря, щорічно утворюється більше 10,000 м 3 твердих відходів, що містять важкі метали і хлорорганічні сполуки, які, просочуючись, потрапляють з водами Селенги в Байкал.
Використовувані у сільськогосподарській діяльності хімічні речовини змиваються дощами в р. Селенга і потім потрапляють в оз. Байкал. Загальна площа сільськогосподарських угідь республіки Бурятія займає 11,2% усієї території Республіки Бурятія.
Дослідження концентрацій забруднюючих речовин у донних відкладеннях і воді у верхній і нижній дельті р. Селенга показали перевищення ГДК в 1,5-2 рази для таких важких металів як мідь, свинець і цинк.
Високий рівень забруднення дельти р. Селенга вважаються головною причиною загибелі ікри омуля.
) Наслідки будівництва Іркутської ГЕС
Наслідки будівництва Іркутської ГЕС - зміна рівня Байкалу
У 1950 р було прийнято рішення про початок будівництва Іркутської ГЕС - першої гідроелектростанції Ангарського каскаду. Гребля ГЕС підняла рівень Байкалу на 1 метр. На проектну потужність Іркутська ГЕС вийшла в 1959 році. При створенні іркутського водосховища було затоплено 220 тис. Гектарів цінних заплавних сільськогосподарських земель. Майже 500 тис. Гектарів цінних лісів з ягідним і мисливськими угіддями опинилися під водою.
Різкі коливання рівня води Байкалу наносять непоправної шкоди флорі і фауні Байкалу. При різкому зниженні рівня води відбувається обсихання нерестовищ цінних порід риб, гине ікра і молодь. Гребля Іркутської ГЕС, яка не має рибопропускних пристроїв, перегородила шляхи міграції риб, що йдуть на нерест у верхів'я Ангари. У водосховищах цінні породи риб, такі як осетрові і Сігов види, витісняються окунем, сорога і ершом. Вчені Бурятії зробили висновок: коливання рівня води негативно впливає на всю екосистему Байкалу, веде до змішання водних мас, сильному руйнуванню берегів. Нерестовища, відтворення рибної маси перебувають під загрозою.
) Забруднення води відходами населених пунктів прибережної зони
Безпосередньо в селах і невеликих містах по берегах Байкалу живуть близько 80000 чоловік.
Приблизний підрахунок показує, що всі ці поселення скидають близько 15 млн. м3 стоків на рік. Очищення побутових, і промислових стічних вод у населених пунктах навколо Байкалу, або відсутня взагалі, або має дуже низьку якість.
) Придонні стоки від Байкальського ЦБК
За обсягом скидів БЦБК порівняємо з р Улан-Уде. Саме тому прихильники запуску комбінату часто кажуть, що він не головний забруднювач Байкалу. Однак, треба враховувати два факти: Улан-Уде - місто, в якому живуть сотні тисяч людей; його скиди потрапляють у річку Селенга і фільтруються, осідають на шляху до Байкалу. БЦБК ж стоїть прямо на березі озера і скидає стоки безпосередньо.
Особливу небезпеку становлять хлорорганічні сполуки. За даними СО РАН, концентрації хлорид-іона в Байкалі в сотні разів менше, ніж у стоках БЦБК. Термін обміну вод в Південному Байкалі становить 200-300 років, тому вчені вважають, що містять хлор в озері накопичуються, захораніваясь в донних опадах. Площа цього забруднення сягає майже 130 квадратних кілометрів.
