згадати бадан товстолистий, що заселяє кам'янисті схили в лісовому поясі і утворює зарості типу пусток у високогір'ї. У деяких типах лісу цей вид домінує в кустарниково-трав'яному покриві.
Сімейство бобових налічує в заповіднику 40 видів. Це різні види конюшини, горошку, астрагалів і Карагай. Серед останніх виділяється карагана гривастих, зустрічається у південній межі заповідника, вона є цінним лікарським рослиною.
Сімейство розоцвітих представлено 54 видами. Сюди відносяться рослини різних життєвих форм. З деревних рослин широко поширені горобина сибірська і черемха звичайна, звичайні у всіх лісових фітоценозах. Крім них зустрічаються яблуня ягідна, глоди криваво-червоний і даурский. Чагарники представлені кизильником чорноплідної, шипшини Даурские і голчастим, звичайної і сахалінської малиною і п'ятьма видами таволг. Серед трав'янистих представників сімейства переважають перстачу - 17 видів.
З сімейств, представлених в основному трав'янистими рослинами, найчисленнішим є сімейство складноцвітих, що містить 92 види. Кілька поступаються йому сімейства мятлікові (71 вид), осокових (61 вид), Лютикова (42 види), хрестоцвітих (39 видів) і гвоздикових (36 видів).
На території заповідника зустрічається більше 50 видів вищих судинних рослин, що відносяться до категорій рідкісних, ендемічних або реліктових. Всі вони підлягають особливій охороні і занесені до Червоної книги Республіки Бурятія, а 12 з них були включені до Червоної книги РРФСР. Це касатік гладкий, анемона байкальська, черевичок крупноквітковий та інші. Два види, сверція байкальська з сімейства тирличевих і стеммаканта хамарская з сімейства складноцвітих, є ендеміками хребта Хамар-Дабан.
Деякі види рослин, на жаль, піддаються дуже інтенсивної експлуатації на суміжних з заповідником територіях. У 1980-ті роки, наприклад, коли йшла посилена заготівля папороті-орляка на експорт, були істотно підірвані його запаси. В останні роки різко знизилися ресурси активно заготовляється населенням у комерційних цілях черемші (цибулі переможного). Страждають від непомірного збору ягідники і популяції цінних лікарських рослин-родіоли рожевої (золотого кореня), стеммаканти хамарской (замінник маралів кореня) і деяких інших видів.
До групи вищих рослин, які ростуть на території заповідника, відносяться також мохоподібні, яких налічується тут 287 видів (Казановський, 1995). Клас печеночников представлений 24 родинами і 81 виглядом. Лістостебельниє мохи також представлені 24 сімействами, але кількість видів, які об'єднуються в них, досягає 206. Гірський характер рельєфу заповідної території зумовлює екотопіческое різноманітність, що сприяє багатству бріофлорьг заповідника. Переважна більшість складають види, проживання яких пов'язане з використанням скельно-кам'янистих субстратів. Багата видами також флора нагрунтових бріофітов і флора підвищено зволожених місць існування. З числа мохоподібних заповідник...
