и», протеоміка ж дає можливість охарактеризувати клітку в даний момент, зафіксувавши все знаходяться в ній білки у свого роду «моментальної фотографії» функціонального стану клітини на рівні її протеома, тобто сукупності всіх ферментних і структурних білків, які «працюють» на відміну від неекспрессірующіхся генів.
При цьому, якщо геноміка з'явилася перш за все в результаті розвитку техніки секвенування, то для протеоміки таку ж основоположну роль грає техніка двомірного електрофорезу - розділення білків в одному напрямку за молекулярною масою, а в іншому - по ізоелектричної точці . Сам по собі цей метод не новий, проте він значною мірою вдосконалено, що дозволяє стежити в динаміці за сотнями білків одночасно.
Протеоміка дозволяє стежити за білковими взаємодіями. Це відноситься, наприклад, до передачі сигналів від поверхні клітини до факторів виборчої транскрипції в ядрі. З її допомогою може бути перетворена, таким чином, не тільки технологія скринінгу імуносупресорів, а й інгібіторів сигнальної трансдукції в цілому. Методи протеоміки дозволяють отримати більш повну, всебічну картину взаємодії з клітиною нових потенційних антимікробних агентів. Роботи з вивчення динаміки біосинтезу ферментів вторинного метаболізму у мікроорганізмів при використанні протеоміки можуть бути переведені на новий, більш високий рівень.
Повертаючись до зв'язку протеоміки з геномікою, слід підкреслити, що протеоміка може бути названа продовженням саме функціональної геноміки. На відміну від геноміки предметом вивчення протеоміки є продукти, які кодуються генами, експресується в даний момент.
Мінімальні геноми мікроорганізмів деяких видів складаються з декількох сотень генів. Геном людини наближається до ста тисяч генів. Розміри окремих генів варіюють приблизно від однієї тисячі пар нуклеотидів і вище. Таким чином, кількість пар нуклеотидів, складових індивідуальний геном, вимірюється як мінімум сотнями тисяч, зазвичай же багатьма мільйонами пар нуклеотидів.
Отже, для повного знання геному організму треба визначити послідовність кількох мільйонів пар нуклеотидів (А-Т - аденін-тимідин, Г-Ц - гуанидин-цитозин). Провести «секвенування», згідно ввійшов у вживання висловом, цілого генома можна тільки за наявності високих технологій і відповідного обладнання.
В даний час в якості щодобового підсумку роботи багатьох десятків лабораторій в різних країнах світу секвеніруют приблизно один мільйон пар нуклеотидів. Зберігати ж отримані дані і користуватися ними неможливо без звернення до спеціальних баз даних, деякі з яких мають статус міжнародних. Широку популярність мають бази даних інституту геномних досліджень (США) і Гейдельберзького університету (Німеччина). Міжнародні бази даних дозволяють отримувати відомості про гені і його поширеності серед патогенів; про кодованої цим геном продукт і про участь цього продукту (як правило, ферменту) в тому чи іншому метаболічному циклі; про каталізірованіі їм конкретної реакції в циклі. Іншими словами, вихідним тест-об'єктом для відбору антимікробних речовин, виборчих інгібіторів метаболізму стає вже не мікробна культура, а ген (точніше, кодується їм продукт).
Необхідно мати на увазі, що різниця по послідовності нуклеотидів геномів різноманітних організмів не обов'язково вказує на міжвидові відмінності; наприклад, у мікроорганізмів...
