У 1783 році Статут затвердив право на установу при Вищій школі двох факультетів, які називаються в той час колегіями. При колегії фізичних наук була відкрита кафедра медицини, де трудився цілий ряд найбільших учених. З Гродненської королівської медичної школи до Вільно прибув відомий медик Жілібера, який очолив кафедру природничих наук. Його соратник Форстер займався дослідницькою роботою в ботанічному саду і зоологічному музеї. Завідував він і шкільної аптекою. Фізіологію і анатомію викладав італієць Бісс. Медичне відділення пишалося вченим Регнер (в 1785 році він був призначений головним хірургом литовського війська). Це він з Парижа запросив прозектора і анатома Бріоті. Професор Бріоті читав лекції цирульникам, в 1806 році при університеті заснував католицький музей і в 1809 році - хірургічну клініку.
У 1804 році з Віденського університету в столицю прибули два найвідоміших медика - батько і син Франки. Професор Петро Франк, відомий клініцист, гігієніст, один з основоположників охорони здоров'я, заснував тут терапевтичну клініку, а його син Йосип - Віленське медичне товариство (1805 році), яке об'єднало всіх столичних медиків і лікарів, що жили в провінції, видавало журнал "Пам'ятки Віленського медичного товариства".
У 1808 році І.Франка заснував Інститут вакцинації, а через рік та Інститут материнства (у Європі таких установ у той час ще не було). Засоби для його філантропічної діяльності давали концерти його дружини, відомої співачки. У міських лікарнях лікувалися зазвичай небагаті люди (Смертність у них досягала 20%). Багатії і люди середнього достатку лікувалися будинку. І хоч смертність в терапевтичній та хірургічній клініках була набагато нижче, представники вищих станів вважали негідним лікуватися під спостереженням студентів. Пацієнтів сюди відбирали професора з урахуванням захворювань, потрібних для практики студентів, багато з яких були членами Маріїнського братства. Вони не тільки дбали про медичні, духовних, але і матеріальних потребах пацієнтів - особливою ретельністю тут відрізнялися діти магнатів.
У 1830 році у Вільні було 170 лікарів, але після закриття Медико-хірургічної академії їх число значно зменшилося. Нескладні операції як і раніше виконували цирульники. У 1848 році у Віленському цеху хірургів працювало 49 майстрів і 16 підмайстрів. Пологи приймали 39 повитух - багато з них були справжніми професіоналами. З другої половини XIX століття велика увага приділялася профілактиці епідемічних захворювань, особливо після спалаху холери (1866-1871года) і віспи (1881-1886 роках).
Стараннями лікаря П. Багенского в 1886 році був відкритий постійно діючий телятник, де проводилися процедури з метою отримати детрит для щеплень проти віспи. З 1897 року з ініціативи лікаря В.Орловський стала діяти станція Пастера, де робилися щеплення проти сказу. На Лукішкском передмісті в 1898 році були успішно проведені випробування парової дезінфекційної камери, що дали найкращі результати згідно санітарно-технічним вимогам гігієни того часу.
Аптеки
Медичну допомогу хворі отримували і в аптеках. У Великому князівстві Литовському вони з'явилися на початку XVI століття. Олександр, король Польщі і князь Великого князівства Литовського (1461-1506), з Болоньї запросив до Вільно відомого алхіміка Олександра Балінського, який привіз звідти свою аптеку. Серед товарів цієї середньовічної аптеки були цілющі трави і коріння, дорогоцінні камені, різні зілля тваринного походження. В 1510 році поблизу палацу був куплений під неї плац. Незабаром Сигізмунд Август писав Барбарі, що вона може бути спокійна: у Вільні є і лікарі, і аптеки.
У столичних аптеках можна було купити не тільки лікарські трави, коріння, настоянки на них, але і різні приправи, тютюн, алкогольні напої, солодощі. Торгували й екзотичними препаратами: зміїним жиром, порошком з єгипетських мумій, кров'ю шибеників, товченими дорогоцінними камінням.
Аптекарів в ті часи було більше, ніж лікарів, і вони були відмінними знавцями лікарських трав. Про це свідчать багаті гербарії, надруковані у Великому князівстві Литовському, якими як навчальними посібниками користувалися за кордоном.
Головна аптека, устаткована єзуїтами, перебувала на розі вулиці Святого Іоанна. Поблизу до XIX столітті знаходився великий сад і город лікарських рослин.
У 1758 році король Август III, беручи до уваги, яку користь приносила аптека Святого Іоанна не тільки в наданні медичної допомоги, а й у підготовці аптекарських кадрів, видав єзуїтам привілей, обеспечивавшую "існування аптеки на вічні часи".
У 1777 року привілей на відкриття своєї аптеки при костелі Святого Духа отримали і ченці-домініканці.
Дві аптеки належали і Віленського університету. У 1832 році в столиці було 15 аптек (5 з них знаходилися при лікарнях).
В аптеці перебували зазвичай два приміщення: одне для дистиляції води і заварювання трав, ...
