ійни 1939-40 років І.А. Кіргетов добровольцем, разом зі своїми учнями, пішов на фронт. А після закінчення боїв залишився служити на командних посадах. p align="justify"> Учасник Великої Вітчизняної війни з червня 1941 року. З перших днів захищав Ленінград. Командував мінометним полком, розташованим на Невської Дубровці. Уміло керував підлеглими в бою. Мінометні батареї Кіргетова з високою точністю накривали позиції гітлерівців. p align="justify"> Відзначився у боях при знятті блокади Ленінграда на початку 1944 року. Командир 174-го мінометного полку підполковник Ісаак Кіргетов в період з 15 по 20 січня 1944 організував ретельне вивчення оборонної смуги і розвідку вогневих засобів противника в районі Пулковських висот, місто Червоне Село (нині в межах Санкт-Петербурга), що дозволило мінометникам знищити 57 кулеметних точок, придушити вогонь 16 батарей.
Указом Президії Верховної Ради СРСР від 1 липня 1944 року за проявлені особистий героїзм і мужність, за організацію чіткої взаємодії з піхотою, вміле і гнучке управління вогнем і маневр полковнику Кіргетову Ісааку Ананійовичу присвоєно звання Героя Радянського Союзу з врученням ордена Леніна і медалі "Золота Зірка" (№ 3742).
Незабаром І.А. Кіргетова призначили командиром 42-й мінометної бригади Резерву Головного командування. Бригада входила до артилерійську дивізію прориву. Її кидали на найвідповідальніші ділянки фронтів. Полковник Кіргетов І.А. командував бригадою в боях за Нарву, за звільнення Естонії, польського міста Гдині (Гданськ). Всього кілька днів не дожив відважний комбриг до Дня Перемоги. 22 квітня 1945 в передмісті Берліна осколок ворожого снаряда обірвав його життя ... Похований у місті-герої Ленінграді (з 1991 року - Санкт-Петербург) на Большеохтінском кладовищі. Нагороджений орденом Леніна, двома орденами Червоного Прапора, орденами Богдана Хмельницького 2-го ступеня, Кутузова 3-го ступеня, Олександра Невського, Вітчизняної війни 1-го ступеня, "Знак Пошани", медаллю. p align="justify"> ... січня 1944 року. Запеклі бої під Гатчиною. Ще до головного наступу підполковник Кіргетов організував ретельне вивчення оборонної смуги всім офіцерським складом полку, виявив і засік всі великі вогневі засоби супротивника. Це дозволило до початку наступу піхоти зруйнувати ряд довгострокових споруд. Ось тільки деякі цифри. Мінометним вогнем знищено понад 20 станкових кулеметів, 12 батарей, 18 дзотів, 29 бліндажів і багато ворожої техніки. p align="justify"> Точно проведена артилерійська підготовка допомогла нашим частинам зломити опір противника і перейти в наступ. Мінометники І.А. Кіргетова і сам командир йшли в бойових порядках піхоти. p align="justify"> Відступаючи, гітлерівці підірвали переправу. Тому міномети і міни довелося переправляти на руках, йдучи по пояс у воді, - лід був розбитий снарядами ворога. У ці штурмові дні Ісаак Ананійович був хворий. Виявилася виразка. Давала себе знати і рана, отримана в битві на бе...