Місцями зустрічаються типчак, осока туркестанська, тонконіг цибулинний, карагана киргизька, тюльпани та інші ефемеровиє рослини. Рослинний покрив рідкісний і доходить до 30 см висоти. Пустельна і напів-пустельна рослинність широко поширена на низинних територіях північних частин Чуйської і західній частині Чон-Кемінського долини. Майже вся територія пустель і напівпустель розорана.
Степова рослинність широко поширена від передгір'я до високогір'я. Основу їх утворюють багаторічні ксерофильние рослини; переважають злакові види. На низькогірному і среднегорном ярусі степові рослини представлені ковильково-різнотравною, а на високогірному альпійськими тіпчаковомі-різнотравними формаціями. Степова рослинність використовується як зимові й осіннє-весняні пасовища.
Лугова та лісо-кустарниково-лучно-степова рослинність розвинена в основному на низькогірному, среднегорном і частково високогірному ярусах північного схилу Киргизького Ала-Тоо, Кюнг Ала-Тоо і хребта Таса-Кемінь. У низкогорьях і среднегорьях лугова і лучно-степова рослинність складається в основному з пирейно-вейніково, Ежев-мятлікові, різнотравно-мятлікові і лучно-мятлікові формації. Саме широке поширення набули Ежев-мятлікові формацій. Місцями в долині річок Чункурчак, Исик-Ата (на висоті 1700-2900 м.) зустрічаються учасники, які складаються виключно з ежего-лучних формацій. Основні рослини: мятлик, осоки, кульбаба, астрагал тибетський, полин дліннокорневимі, ??вероніка колосиста, перстач та ін мятліковими лугова-степова рослинність поширена на недостатня зволожених, північно - східних і північно - західних експозиціях гір центральної і східної частин області. Основу лугових і лучно-степових рослин утворюють мезофільні і мезоксерофільние багаторічні злакові види. Проективне покриття грунту 80-90%. Середня висота травостою 60-70 см, місцями перевищує 1 метр. Використовується в літній час як сінокісні і пасовищні угіддя.
Лугова і лучно-степова-лісо-чагарникова рослинність розвинена в основному на середньогірських ізольованих ділянках північній і північно-східній експозиції гір, де є достатні зволоження. Зустрічаються ялина тянь-шаньская, арча; з чагарників: горобина, смородина та ін Ялинові ліси ростуть на висоті 2200-2700 метрів у басейні річок Сокулук, Ала-Арча, Аламудун, Исик-Ата, Кегеті, Шамші, Чон і Кичи-Кемінь.
арчовая ліси зустрічаються на перехідній смузі (2600-3200 м) між среднегорьями і високогір'я. Середня висота ялинових лісів 25-30 метрів, середній діаметр крони 59-70 см. У межах області виростають можжевельніковие і напівкулясті арчі. Ліси і чагарникові зарості на схилах гір охороняються законом, тому що мають величезне водорегулююче і водоохоронних значення. В останні 50-60 років площа природних ялинових лісів скоротилася 1,5-2 рази.
Високогірна альпійська степова рослинність розвинена в основному на схилах гір (2800-3300 метрів над рівнем моря). Основу складають типчак валезійскій, костриця Крилова, тонконіг альпійський та ін Зустрічаються кульбаба альпійський, осоко узкоплодная, цибуля Тянь-Шаньський, флеміс гірський, незабудка запашна та ін Високогірні і степові рослини поширені в основному в східній частині в басейні річок Кизил-Суу, Кек-Жар-Суу, Кичи і Чонкемін. Долини широкою смугою представлені на південної експозиції гір, звернених до Чон-Кемінського долині. Проективне покриття грунту степів доходить до 60-70...
