липня король вперше був присутній на католицькій службі в храмі в Сен-Дені, після чого єпископ Буржскій урочисто оголосив про його повернення в лоно римської церкви. Ледь про це стало відомо в столиці, багато парижани, незважаючи на заборону герцога Майенского, поспішили в Сен-Дені вітати свого короля. Гугеноти, хоча і засуджували Генріха за зміну віросповідання, продовжували тримати його сторону, розуміючи, що цей король ніколи не почне проти них релігійних гонінь. Герцог Майенский марно закликав своїх прихильників до зброї і переконував їх не вірити «удаваному зверненням» короля. Його ніхто не хотів слухати. Міста і вельможі поступово припиняли боротьбу, одні добровільно, а інші продаючи свою вірність на більш-менш вигідних умовах.
Таким чином Генріх заволодів своїм королівством «вроздріб і по клаптиках», за висловом Сюллі. Він вступив у січні 1594 в Мо, який був зданий йому комендантом цього міста Витри. Потім отримав Орлеан і Бурж від Ла-Шатра і Екс в Провансі від місцевого парламенту. У лютому здали своє місто ліонські політики. У Шартре Генріх був урочисто помазаний по старому звичаю французьких королів і 22 березня без бою ввійшов у Париж. Тоді ж були закінчені переговори про здачу Руана. Лаон, Ам'єн та інші міста Пікардії, що вважалися колискою Ліги, один за іншим відкривали свої ворота. Карл Гіз, племінник герцога Майенского, віддав Генріху Шампань. Кожен з таких договорів коштував королю численних поступок у вигляді роздачі почесних відзнак, політичних прав і особливо грошових сум. Генріх щедро роздавав титули, призначав пенсії, сплачував чужі борги, віддаючи перевагу матеріальні витрати кровопролиття. Але там, де переговори не давали очікуваного результату, король пускав у хід зброю. У липні 1595 в битві при Фонтене Франсез він завдав поразки своєму старому ворогові герцогові Маєн-ському і відібрав у нього Бургундію. Але потім уклав з ним дуже стерпний договір, намагаючись усіляко щадити його політичні та релігійні почуття: скрізь, де це було можливо, король намагався бути вище особистої ворожнечі. У вересні папа Климент VIII, побоюючись, як би французька церква не вийшла з-під його впливу, зняв з Генріха церковне відлучення і уклав з ним формальний мир. Але тривала війна з іспанським королем, вперто не визнавали прав Генріха на французьку корону. У 1595 іспанці взяли Камбре, в 1596 р. - Кале і, нарешті, в 1597 р. - Ам'єн. Але, незважаючи на ці успіхи, Пилип як і раніше не мав ніякої надії позбавити влади Генріха. Грошей на продовження війни в нього не було, і в травні 1598 іспанський король погодився на мир. Усі завойовані їм провінції були повернуті Франції. Останнім оплотом лігістів залишалася Бретань, захоплена герцогом Меркера. Генріх сам виступив проти нього і примусив до покірності.
Підсумок релігійним війнам у Франції підвів Нантський едикт, підписаний королем у квітні 1598 Це був важливий акт, який стверджував основи державної політики віротерпимості. Хоча вільного викладання і богослужіння у гугенотів не було, в громадянськи правах вони були повністю зрівняні з католиками і отримав доступ до всіх державних громадським посадам. Реформаторський богослужіння було по раніше заборонено в Парижі. Однак воно було дозволено всюди, де було введено раніше, а саме: у кожному адміністративному окрузі, в замках вельмож і навіть будинках простих дворян. Всі едикти і судові вироки, спрямовані проти гугенотів під час релігійних гонінь, були оголошені...
