е узгоджується з експериментальними даними для згаданих вище білків [72, 84, 70]. У разі, якщо фермент являє собою комплекс, наприклад, протромбінази, концентрація його дорівнює:
(84)
У літературі є експериментальні дані по людської теназе тільки для [PCPS] = 25 мкМ. У модельованих нами експериментах [PCPS] = 200 мкМ, на порядок більше. На цій підставі ми збільшили константу Міхаеліса з 190 до 4000 нМ, використовуючи для верифікації Рис. 12. br/>В
Рис. 13. Освіта фактора Xa в очищеній системі, яка містить фактори IX, X, VIII, V, II в концентраціях, вказаних в Таблиці 1. Активація проводиться 1.25 пМ комплексу VIIa-TF. Експериментальні дані (?) Взяті з роботи [87]. Теоретичні розрахунки (гладкі криві) зроблені за моделлю (9-34). Константа Міхаеліса для активації фактора X внутрішньої теназой дорівнює 190 нМ (пунктир) або 4000 нМ (суцільна лінія). Всі інші константи відповідають Таблиці 2
Розглянемо аналогічну задачу для реакції протромбінази, що протікає на тромбоцитах. На відміну від штучної поверхні, на тромбоцитах спочатку зв'язується фактор Va, а потім з ним зв'язується фактор Xa [83]. Концентрація пов'язаного з мембраною фактора Va є
(85)
де - концентрація специфічних сайтів, - константа дисоціації. Концентрація протромбінази визначається аналогічною формулою для Xa, тільки замість числа сайтів підставляється концентрація пов'язаного Va:
(86)
Для швидкості активації протромбіну маємо:
v === (87)
.4 Вплив кінетичних констант реакцій згортання на кінетику системи
Природне запитання, що виникає при побудові моделі, пов'язаний із залежністю результатів моделювання від параметрів системи. Він має два аспекти: по-перше, відповідь на нього дозволяє глибше зрозуміти об'єкт, оцінити роль окремих параметрів у функціонуванні системи, по-друге, подібне дослідження допомагає оцінити стійкість моделі по відношенню до варіювання параметрів і необхідність додаткового дослідження найбільш важливих з них.
В В
Рис. 14. Залежність лаг-фази (панель А) і максимальної швидкості виробництва тромбіну (панель Б) в очищених системах від концентрації активатора. Система містить фактори IX, X, VIII, V, II в концентраціях, вказаних в Таблиці 1
Активація проводиться комплексом VIIa-TF, концентрації вказані на малюнку. Експериментальні дані (?) Взяті з роботи [88]. Теоретичні розрахунки (гладкі криві) зроблені за моделлю (9-34). Константи реакцій відповідають Таблиці 2. Усі графіки кінетики тромбіну у реконструйованих системах у відсутність інгібіторів мають один і той же вид: лаг-фаза, коли тромбін помітна не напрацьовується, швидкий розгін, майже лінійне зростання, гальмування, плато. Використовуючи цю однорідність, можна спробувати виділити кілька параметрів, що характеризують графік. ...
