У 1922 році на першому з'їзді лікарів Туркестану він виступав з чотирма об'ємними доповідями будучи в рясі і з хрестом на грудях" .
Цікавий випадок стався з професором-священиком під час служіння його на ташкентської кафедрі.
Влітку 1921 року в Ташкент були доставлені з Бухари lt; # justify gt; архієпископ лука святитель хірургія
До твердому і неухильного виконання заповідаю вам: неколебимо стояти на тому шляху, на який я навів вас. Підкорятися силі, якщо будуть відбирати від вас храми і віддавати їх у розпорядження дикого вепра, попущением Божим вознісся на горньому місці соборного храму нашого. Зовнішністю богослужіння не спокушатися і наруги богослужіння, твореного вепром, не вважати богослужінням. Йти в храми, де служать гідні ієреї, вепрові не підпорядковані. Якщо і всіма храмами заволодіє вепр, вважати себе відлученим Богом від храмів і вкиненому в голод слухання слова Божого. З вепром і його прислужниками ніякого спілкування не мати і не принижуватися до сперечання з ними. Проти влади, поставленої нам Богом за гріхами нашими, ніяк нітрохи не повставати і в усьому їй смиренно коритися. Владою спадкоємства апостольського, даного мені Господом нашим Ісусом Христом, наказую всім чадам Туркестанської Церкви строго і неухильно дотримуватися мій заповіт. Відступаючим від нього і входять з вепром в молитовне спілкування погрожую гнівом і засудженням Божим .
Співробітники ГПУ гарячково шукали причину, щоб запроторити Святителя за грати. Вони висунули звинувачення, за яким єпископ Лука підозрювався у зв'язках з оренбурзькими контрреволюційними козаками і в шпигунстві на користь англійців через турецький кордон raquo ;. Причому все це він робив нібито одночасно. Всі пояснення єпископа Луки, що він фізично не міг бути одночасно на Уралі і на Кавказі, в розрахунок не приймалися. Поки святитель нудився в катівнях ГПУ, в місто приїхав обновленческий єпископ Миколай Коблов, і всі церкви в місті були захоплені розкольниками. Але храми ці стояли порожніми - народ пам'ятав заповіт єпископа Луки.
Всю ніч перед від'їздом до нього йшли люди, щоб попрощатися і отримати благословення і наставляння. Скорбота народу про улюбленого архіпастиря була така велика, що віруючі лягали на рейки, щоб не дати відвезти свого Владику.
У свою перше посилання Святитель Лука вирушив через Москву, де органами НКВС було проведено слідство. Після нього 24 жовтня lt; # justify gt; Цей кримінальний процес збігся з новою хвилею гонінь на церкву. Ставлення до релігійних діячів визначалося тим же сталінським тезою про загострення класової боротьби у міру успіхів соціалістичного будівництва. І церква як інститут, який не можна відокремити від суспільства, разом з усім суспільством пережила страшні наслідки застосування сталінської теорії на практиці.
травня 1930 В.Ф. Войно-Ясенецького заарештували, і тільки через рік - 15 травня 1931 - рішенням надзвичайної трійки ОГПУ він був засуджений до заслання на три роки з обчисленням строку з дня арешту. Войно-Ясенецькому ставилося в провину підбурювання до самогубства професора Михайлівського. В Архангельську йому була дозволена медична практика без хірургії, від чого він дуже страждав. " Хірургія - це та пісня, яку я не можу не співати, - писав Валентин Феліксович додому. У листопаді 1933 року архангельська посилання скінчилася. Короткий період він жив і працював у Москві, Феодосії, знову в Архангельську, потім в Андижані. І, нарешті , повернувся в Ташкент, де разом з родиною оселився в невеликому будиночку на березі Салар, недалеко від польського костелу. Валентин Феліксович - одночасно єпископ Сергиевской церкви, розташованої на розі Асакінской та Пушкінської вулиць, і завідувач недавно відкритим відділенням гнійної хірургії в Інституті невідкладної допомоги. У відділенні під його керівництвом працювали хірурги М.А. Ротенберг, Г. Ільїн - майбутні професори і доценти хірургічних клінік. У 1935 році професор В.Ф. Войно-Ясенецький запрошується на керівництво кафедрою хірургії Інституту удосконалення лікарів, а в грудні цього ж року Наркомздрав УзССР присуджує йому вчений ступінь доктора наук без захисту дисертації.
Після довгих турбот і труднощів, нарешті, в 1934 році здійснилася багаторічна мрія професора - були видані Нариси гнійної хірургії, в яких узагальнено багатющий досвід автора. У вступі він пише: Надзвичайно важкий шлях сільського хірурга-самоучки, який мені довелося пройти, навчив мене вельми багато чому, ніж хотілося б тепер, на схилі моєї хірургічної діяльності поділитися з молодими лікарями.
Подібних публікацій раніше не було. У передмові до книги професор В.С. Левіт підкреслив, що," володіючи гарною мовою і легким стилем, автор в такій формі викладає історії хвороби, що створюється враження, ніби хворий тут же присутній, тут же обстежується і демонструєть...
