-проб, перевіряти відповідність набору проб чіпу, зручно керувати метаданими пацієнта, а так само вибирати пацієнтів за списком наявних проб. p align="justify"> Мета роботи - Створення модуля Drupal для зберігання інформації з результатами експериментів з аналізу експресії генів і її адміністрування (в рамках завдання розробки підлих БД аналізів ДНК-мікрочіпів, запропонованої інститутом епідеміології і мікробіології імені Н.Ф. Гамалії ).
Завдання роботи:
1. Ознайомитися з теоретичними та емпіричним аспектами, а так само історією створення ДНК-мікрочіпів;
. Вивчити структури баз даних по пробам ДНК мікрочіпів ( GEO , Array Express а так само БД інституту Гамалії Microarrays (cluster.gamaleya.org));
. Ізучітьуже існуюче програмне забезпечення для роботи з даними отриманими з ДНК мікрочіпів;
. Вивчити мову PHP;
. Вивчити синтаксис MySQL запитів;
. Вивчити будову і структуру написання модуля на Drupal (Вивчити систему управління сайтом Drupal; Охарактеризувати її основні можливості; Вивчити методи розробки модулів на Drupal; Порівняти Drupalс іншими CMS);
. Написати модуль для управління наборами пацієнтів і проб за допомогою Drupal-6, за допомогою якого можна: а) створювати, видаляти, редагувати набори проб, б) зручно керувати метаданими пацієнта, в) вибирати пацієнтів за списком наявних проб.
1. ДОСЛІДЖЕННЯ ПРЕДМЕТНОЇ ОБЛАСТІ
1. ДНК-мікрочіпи. Експресія гена. Способи зберігання та обробки інформації, отриманої за допомогою ДНК-аналізів
У поточний момент більшої популярності набуває метод діагностики захворювань на основі вивчення процесу експресії генів [2]. Масова діагностика на основі експресії генів в медичних лабораторіях стає можливою завдяки появі технології створення так званих ДНК-мікрочіпів. p align="justify"> ДНК-мікрочіпи - технологія, коли на підкладку, зі скла або кремнію в певні заздалегідь позиції підкладки наноситься шар коротких від (20 до 60 нуклеотидів) одноланцюгових молекул ДНК. Послідовність нуклеотидів кожної з молекул відома заздалегідь. Ця послідовність найчастіше відповідає одному з фрагментів досліджуваного гена або одному з фрагментів відомого геномного повтору. Всі підкладки поміщаються в спеціальний розчин, в якому містяться досліджувані пофарбовані фрагменти молекул ДНК, які зв'язуються з фрагментами на підкладці за принципом компліментарності. p ali...
