озуміння завдань алхімії було викладено в працях основоположників технічної хімії Ваноччо Бірінгуччо (1480-1539) «Про піротехніі» і Георга Бауера (1494-1555), більш відомого як Агрікола, De Re Metallica (« Про металургії »). Твори цих авторів представляли собою свого роду енциклопедії, присвячені мінералогії, металургії, гірничої справи, виробництва кераміки, тобто технологічних процесів, що передбачає хімічні операції з речовинами. Характерною особливістю праць представників технічної хімії стало прагнення до максимально ясному, повного й достовірного опису досвідчених даних і технологічних процесів. Саме в пошуках способів вдосконалення хімічної технології Бірінгуччо і Агрікола вбачали завдання алхімії.
Німецький лікар і алхімік Філіп Ауреол Теофраст Бомбаст фон Гогенгейм, який увійшов в історію під псевдонімом Парацельс (1493-1541) став основоположником іншого раціонального напрямку в алхімії - іатрохіміі (іноді ятрохімія; від грецького ????? ? - лікар). У теоретичному відношенні Парацельс був класичним алхіміком - він поділяв давньогрецьке вчення про чотири елементи-стихіях і арабську теорію трьох принципів. Парацельс не був чужий містиці - він займався пошуками еліксиру життя і навіть стверджував, ніби знайшов його; в його творах можна знайти докладний рецепт приготування гомункулуса. Однак, подібно Авиценне, Парацельс негативно ставився до ідеї трансмутації металів (не заперечуючи, втім, принципової можливості трансмутації). Парацельс стверджував, що завдання алхімії - виготовлення ліків: «Хімія - один із стовпів, на які повинна спиратися лікарська наука. Завдання хімії зовсім не в тому, щоб робити золото і срібло, а в тому, щоб готувати ліки ». Медицина Парацельса грунтувалася на ртутно-сірчаної теорії. Він вважав, що в здоровому організмі три принципи - Ртуть, Сірка і Сіль - знаходяться в рівновазі; хвороба представляє порушення рівноваги між принципами. Для відновлення рівноваги Парацельс використовував в медичній практиці багато лікарських препаратів мінерального походження - сполуки миш'яку, сурми, свинцю, ртуті і т.п.- На додаток до традиційних рослинним препаратам.
Внаслідок різко посилилися міграцій людей, що сприяють поширенню інфекційних захворювань (що посилювалося панує в середньовічній Європі тотальної антисанітарією), боротьба з епідеміями придбала за часів Парацельса надзвичайне значення. Завдяки безсумнівним успіхам, досягнутим Парацельсом в медицині, його погляди завоювали широке визнання. До представників іатрохіміі (спагірікам, як називали себе послідовники Парацельса) можна віднести багатьох відомих алхіміків XVI-XVII століть.
Андреас Лібава (1550-1616) прославився першим в історії підручником хімії - «Алхімія», - вийшли в 1597 році. Погоджуючись з Парацельсом в тому, що головне завдання алхімії полягає в служінні медицині, Лібава люто критикував туманно-містичні елементи у вченні Парацельса. Тим не менш, він вважав, що трансмутація можлива, і її здійснення з'явиться вінцем науки. Інший видатний представник іатрохіміі - італійський лікар Анджело Сала (1576-1637), навпаки, заперечував можливість трансмутації металів: «... бо те, що не золото, ні я і ніхто інший не зможе ніколи перетворити на золото».
Важливу роль у розвитку раціональної алхімії зіграв Йоганн Рудольф Глаубер (1604-1670), який розробив способи отримання цілого ряду неорганічних речовин. Інший відомий алхімік Отто Тахеній (1620-1699) спробував внести зміни до ртутно-сірчану теорію, стверджуючи, що всі солі утворені двома принципами - кислотою і лугом.
Ще один представник іатрохіміі Ян Баптист ван Гельмонт (1577-1664) був одним з перших учених, які поставили питання про істинні простих складових частинах складних тел. Піддаючи сумніву аристотелевские стихії і принципи алхіміків на тій підставі, що їх присутність неможливо виявити в складі більшості тіл, Ван Гельмонт пропонував вважати простими тілами лише ті, які можуть бути виділені при розкладанні складних тел. Так, оскільки при розкладанні рослинних і тваринних речовин завжди виділялася вода, Ван Гельмонт вважав її простим тілом і головною складовою частиною складних тел. У пошуках інших простих тіл Ван Гельмонт багато експериментував з металами. Він довів, що при розчиненні срібла в міцній горілці (азотній кислоті) метал лише змінює форму свого існування і може бути знову виділений з розчину в тій же кількості. Цей досвід цікавий і як один з перших прикладів кількісного дослідження явища.
У цілому раціональні течії в алхімії - іатрохіміі і технічна хімія - досягли досить значних експериментальних успіхів і заклали основи для наукової хімії, становлення якої починається в середині XVII століття. Не слід, однак, вважати, що поява наукової хімії автоматично означало кінець «класичної» алхімії. Алхімічні традиції зберігалися в науці ще довгий час, і багато видатних натуралісти продовжува...