бо формулюються кримінально-правові інститути.
У кодексі застосовується суцільна нумерація статей, глав і розділів. Якщо в кодекс включаються нові статті або глави, нумерація вже існуючих не змінюється, а додати статтю або глави отримують номер найбільш близькою за змістом структурної одиниці кодексу з додаванням цифрового позначення, записуваного через крапку або верхнім індексом: 104.1 або 104 ?. У разі виключення статті нумерація інших статей також не змінюється, а на місці виключений статті робиться відповідний запис.
Порядок введення в дію Кримінального кодексу РФ викладено в спеціальному федеральному законі «Про введення в дію Кримінального кодексу Російської Федерації». Згідно з ним, Кримінальний кодекс РФ набув чинності з 1 січня 1997 року, за винятком деяких положень. Згідно ст. 4 цього закону, окремі положення про покарання вводяться в дію в міру створення необхідних умов для їх виконання, але не пізніше певного терміну: норми про покарання у вигляді обов'язкових робіт - не пізніше 2004 року, про покарання у вигляді обмеження волі - не пізніше 2005 , і про покарання у вигляді арешту - не пізніше 2006 року.
У федеральних законах, що вносять зміни та доповнення до КК РФ, також може вказуватися особливий термін набрання ними чинності. Якщо такий строк не вказано, використовується загальний порядок, викладений у Федеральному законі від 14 червня 1994 року «Про порядок опублікування і набрання чинності федеральних конституційних законів, федеральних законів, актів палат Федеральних Зборів Російської Федерації». Згідно з ним, федеральні закони вступають в силу одночасно на всій території Російської Федерації після закінчення 10 днів після дня їх офіційного опублікування. Офіційним опублікуванням вважається перша публікація повного тексту закону в «Парламентській газеті», «Російській газеті» або Зборах законодавства Російської Федерації. Офіційними також є тексти законів, які поширюються в електронній формі НТЦ «Система». При цьому відлік 10-денного терміну починається від дати публікації в «Парламентській газеті» або «Российской газете».
Згідно ст. 9 КК РФ, злочинність і караність діяння визначаються кримінальним законом, який діяв на час вчинення цього діяння. При цьому часом вчинення злочину визнається час вчинення суспільно небезпечного діяння (бездіяльності) незалежно від часу настання наслідків. У продовжуваних злочинах цей момент визначається моментом вчинення останнього із дій, в які тривають - моментом добровільного або примусового припинення злочину.
Як виняток карному закону може надаватися зворотна сила, тобто його дія поширюється на осіб, які вчинили злочин до набрання таким законом чинності, у тому числі на осіб, які відбувають покарання або відбули покарання, але мають судимість. Ст. 10 КК РФ встановлює, що зворотну силу має кримінальний закон, який скасовує злочинність діяння, пом'якшує покарання або іншим чином поліпшує становище особи, яка вчинила злочин. Ні в яких інших випадках зворотна сила кримінального закону придаватися не може, це заборонено ст. 54 Конституції РФ.
У випадку, якщо новий кримінальний закон декриміналізує (визнає незлочинним) будь-яке діяння, з моменту його вступу в силу повинні бути припинені всі кримінальні справи про таке діяння, за якими ведеться попереднє розслідування чи судовий розгляд, а особи, вже відбувають покарання за таке діяння, підлягають звільненню. Згідно з ч. 2 ст. 10 КК РФ, якщо новий кримінальний закон пом'якшує покарання за діяння, яке відбуває особою, то це покарання підлягає скороченню в межах, передбачених новим кримінальним законом.
Спірним є питання про можливість застосування зворотної сили закону, якщо декриміналізація відбувається в силу зміни нормативного акта іншої галузі права, до якого робить відсилання Кримінальний кодекс (наприклад, Правил дорожнього руху). В одному зі своїх визначень Конституційний суд РФ дав таке тлумачення закону: «декриміналізація тих чи інших діянь може здійснюватися не тільки шляхом внесення відповідних змін в кримінальне законодавство, а й шляхом скасування нормативних приписів іншої галузевої приналежності, до яких відсилали бланкетні норми кримінального закону, або обмеження обсягу кримінально-правового регулювання в результаті законодавчого визнання будь-якого діяння не представляють суспільної небезпеки, властивої саме злочинам, і манливим на даному підставі адміністративну або іншу більш м'яку відповідальність ». В іншому випадку Конституційним судом РФ встановлено, що положення про зворотну силу відносяться тільки до норм кримінального закону, а не до норм законодавства, що відноситься до інших галузей права; потрібно відзначити, що з даним тлумаченням погодилися не всі члени Конституційного суду: судді Т. Г. Морщакова і А. Л. Кононов висловили протилежне особливу думку.