1998 [13] спеціально уповноважені державні органи у сфері охорони навколишнього природного середовища мають власні структури територіальних органів, які, відповідно до законодавством РФ, вирішують питання в області охорони навколишнього природного середовища з вищевказаними надвідомчими органами.
Взаємодія між цими органами здійснюється на основі нормативних актів (постанови, накази і т. д.), договорів (угодах), що містять норми права з екологічних питань, укладені між Російською Федерацією і її суб'єктами. Таким є такі правові акти (постанови, листа й т.д.) дотичні застосування законодавства у сфері охорони тваринного світу. Ці акти обов'язкові для судів відповідних судових систем територіального рівня. У таких актах утримуватися не нові правові норми, а роз'яснення й тлумачення застосування наявного законодавства, насамперед, з питань підвідомчості, спрямовані на забезпечення єдності правозастосування й усунення прогалин у законодавстві в судовій практиці, що має важливе значення для цієї практики.
Нормативні правові акти федеральних міністерств і відомств (накази, інструкції, роз'яснення, вказівки, положення і т. д.), що містять одну або більше норм, зачіпають права, свободи, законні інтереси громадян, гарантії їх здійснення, а також акти, що мають міжвідомчий характер, підлягають державної реєстрації у Федеральному органі юстиції опублікуванню. [14] Тільки після цього вони знаходять повну юридичну чинність і можуть виконуватися територіальними органами.
Форма взаємодії федерального органу виконавчої влади з органом виконавчої влади суб'єкта Федерації - Угода про передачі частини своїх повноважень.
Діюча правова система дозволяє державним органам влади (федеральним, регіональним), органам місцевого самоврядування давати завдання суб'єктам господарювання по виконанню конкретних природоохоронних заходів тільки виділенням необхідного об'єму фінансування.
Законом встановлено коло повноважень посадових осіб спеціалізованих органів екологічного контролю:
Г? відвідувати підприємства, установи та організації незалежно від форм власності і знайомиться з документами, необхідними для виконання службових обов'язків;
Г? перевіряти роботу очисних споруд і установок, а також встановлених природоохоронних вимог і нормативів;
Г? призначати державну екологічну експертизу;
Г? вимагати усунення виявлених недоліків, притягати винних осіб до адміністративної відповідальності, направляти матеріали про притягнення їх до адміністративної, дисциплінарної або кримінальної відповідальності, пред'являти позови до суду або арбітражного суду про відшкодування шкоди, заподіяної навколишньому середовищу і здоров'ю громадян;
Г? приймати рішення про обмеження, призупинення, припинення функціонування будь-яких підприємств і об'єктів, а також видів діяльності, у разі порушення екологічних вимог.
У процесі проведення екологічного контрол...