півночі, архіпелагів Чілое і Чонос.
липня «Бігль» кинув якір в порту міста Вальпараїсо, головному порту Чилі. Тут експедиція могла спостерігати за горою Аконкагуа, найвищою точкою Південної Америки: «Ця неправильна конічна верщіна піднімається вище Чимборасо; відповідно до вимірами, виконаними офіцерами на «Біглі», висота її не менше 23000 футів. Взагалі, Кордильєри, що проглядаються звідси, більшою частиною своєї краси завдячують особливостям тутешнього повітря. Коли сонце заходило в Тихий океан, чудово було спостерігати, як чітко вимальовувалися їхні суворі обриси і як різноманітні і ніжні при цьому були їх відтінки ».
Серпень Дарвін провів екскурсію на конях, щоб геологічно досліджувати підніжжя Анд, які не були покриті снігом. 15 серпня вчений відвідав долину Кільйота, 17 серпня - піднявся на гору Кампана, 19 серпня прибув до містечка Хахуель, де пробув тиждень. 26 серпня Дарвін провів екскурсію в закриту долину Гітрон, звідки потрапив до столиці Чилі - Сантьяго. У цьому місті він пробув тиждень і 6 серпня прибув у Ранкагуа, 13 серпня - в Ріо-Клара, звідки повернув на місто Сан-Фернандо. 27 серпня вчений пішов у місто Вальпараїсо і по хворобі пробув там до кінця жовтня. Під час екскурсій по центральному Чилі Дарвін проводив цінні для науки спостереження за рельєфом, геологією і кліматом місцевості. Менша увага він приділяв вимиранню видів.
листопада «Бігль» відплив на південь для картографічних зйомок і 21 листопада прибув до міста Сан-Карлос, головне місто острова Чилое. 24 листопада два шлюпки під командуванням Салів були направлені для зйомки східного узбережжя, сам «Бігль» займався зйомкою західного і південного берегів острова, Дарвін пройшов острів на конях спочатку в північній частині, а 30 листопада прибув на схід, де зустрівся зі всією експедицією. 1 грудня корабель відплив до острова Лемуй, потім до острова Сан-Педро. 10 грудня «Бігль» попрямував на південь і 13 грудня досяг архіпелагу Чонос. Пробувши там до 18 грудня корабель повернув на південь і 30 грудня досяг півострова Трес-Монтес. 7 січня 1835 експедиція повернулася до архіпелагу Чонос, де пробула тиждень. Дарвін займався описом і дослідженням геології островів, при цьому не виключаючи дослідження флори і фауни. Було описано багато рослин, які утворюють ліси на островах - Астеліт (англ.) Рос. (Astelia), Донато (англ.) Рос. (Donatia), мирт (Myrtus), водяника (Empetrum), ситник (Juncus), серед тварин - калан, гризуни нутрія і капибара, птахи чеукау (англ.) Рос., Буревісники і пищухи.
сiчня «Бігль» вийшов з гавані Лоу, що на півночі архіпелагу Чонос, і через 3 дня кинув якір вдруге в бухті порту Сан-Карлос на острові Чилое. 19 січня експедиція спостерігала виверження вулкана Осорно, яке співпало з виверженням Аконкагуа і Косегуіни. Це Дарвіна дуже зацікавило, адже вулкан Косегуіна НЕ вивергався 26 років, а Аконкагуа взагалі виявляв активність дуже рідко. Капітан Фіцрой проводив зйомки уздовж західного берега острова, а Дарвін перетнув його зі сходу в меридіональному напрямку. По дорозі він відвідав озеро Кука і поселення індіанців. 4 лютого «Бігль» відплив від Чілое на північ і 8 лютого прибув до Вальдівію. 11 лютого Дарвін провів невелику екскурсію по околицях 20 лютого став свідком землетрусу, найсильнішого в цьому місті за всю його історію. 4 березня експедиція прибула в порт Талькауано міста Консепсьон, де після землетрусу залишилися тільки руїни. Пробувши тут 3 дні, корабель відплив до Вальпараїсо, і 11 березня кинув якір у його порту. Дарвін відбув до Сантьяго, звідки мав намір провести похід через Анди до аргентинського міста Мендоса. 18 березня експедиція вийшла в сторону перевалу Портільо. Доро? гой Дарвін вів записи з досліджень геології навколишніх гір. 23 березня вчений перетнув перевал і почав спуск крутим східним схилом Анд. 27 березня експедиція досягла міста Мендоса, а 29 березня повернула назад, але вже через перевал Успальята, який знаходився трохи північніше. 1 квітня Дарвін перейшов перевалом, 4 квітня досяг Моста Інків і 10 квітня прибув назад до Сантьяго. Через кілька днів він повернувся до Вальпараїсо, де зустрівся з кораблем «Бігль».
Березень Дарвін організував нову експедицію на північ країни, а саме за маршрутом Вальпараїсо - Кокімбо - Гуаско - Копьяпо. Саме в Копьяпо його повинен був забрати капітан Фіцрой, і звідти попрямувати на північ до Галапагоських островів. Спочатку шлях проходив уздовж тихоокеанського узбережжя, але потім повернув вглиб Чилі, перетинаючи долини багатьох річок. 14 травня Дарвін дістався до Кокимбо, де описав геологію місцевих терас, складених із залишків стародавніх молюсків. 2 червня експедиція досягла Гуаско, де пройшла пустельними рівнинами і стала свідком ще одного землетрусу, а 22 червня - Копьяпо. Оскільки «Бігль» ще не прибув у порт, Дарвін провів невелику подорож в Анди, і 1 липня повернувся назад. 4 липня прибу...