івно, період багатоводдя (середина - кінець 90-х) виступив в деякій мірі каталізатором, в силу того, що необхідні обсяги води все ж надходили для задоволення як гідроенергетичних, так і іригаційних потреб на різних рівнях течії. Однак у межвегетаціонний період нездатність впоратися з нехарактерно великими водними обсягами привела до затоплень Арнасайской низовини і як наслідок перегляду механізмів водно-енергетичного співробітництва в Центральній Азії.
Міждержавне співробітництво з управління водними ресурсами транскордонних річок Центральної Азії в більшості випадків концентрувалася на великих річках регіону. До того ж, увага експертів і вчених-водників з впровадження міжнародного досвіду з інтегрованого управління водними ресурсами зводилися до вирішення общерегіональних водних проблем. Тим часом, після усвідомлення факту неможливості результативної співпраці в багатосторонньому форматі в кінці 90-х, країни стали орієнтуватися на двосторонній принцип взаємодії. Казахстан і Киргизстан в даному випадку являють собою одним з небагатьох винятків у спільному використанні вод транскордонних річок.
У 2000 р Казахстан і Киргизстан підписали угоду «Про використання водогосподарських споруд міждержавного користування на річках Чу і Талас», що припускає впровадження принципу платності, а вірніше спільного фінансування інфраструктури транскордонних вод виходячи з споживаної кількості води в басейні річок Чу-Талас. Згідно визнаним домовленостям, фактичне щорічне фінансування Казахстаном в період з 1998 по 2003 р було збільшено з 7 до 190 тис. Дол. США. Необхідно відзначити, що підписання угоди передувало Положення «Про поділ стоку в басейні р. Талас »1983, дія якого було в силі незважаючи на розвал СРСР, а також щорічні міждержавні протоколи, що регулюють узгодження графіку подачі води, компенсацію Казахстаном експлуатаційних витрат гідрооб'єктів. Багато в чому поведінка казахстанської влади, на думку міжнародних експертів, було наслідком нестачі води в поливний сезон через некоректне режиму роботи Кіровського водосховища. Тобто якщо в радянський період, пік скидання води починався в червні, то починаючи з 1995 по 1999 рр. графік зрушувався на місяць пізніше, тобто на липень. Тим не менш, стверджувати, що саме це послужило передумовою для водного взаємодії не представляється остаточно вірним.
Більш-менш рівноправний характер взаємодії, обумовлений постійною ротацією керівництва міждержавної Комісії та Секретаріату (створені в 2006 р), забезпечує врахування інтересів обох сторін. І беручи до уваги, сучасний стан водної проблематики в регіоні з постановкою своїх інтересів з домінуючої позиції і спробами нав'язування своїх інтересів іншим країнам, такий підхід здається єдино прийнятним. Прецедент, створений Киргизстаном і Казахстаном в регіоні щодо взаємних витрат за експлуатацію гідроспоруд, вніс великі коригування у водно-енергетичні відносини. Сама концепція нести спільні витрати за експлуатацію гідроспоруд Киргизстану була не нова і була одним з головних принципів водного співробітництва ще в радянські часи. Планомірна доробка Киргизстаном ідеї в період незалежності остаточно придбала правовий статус з прийняттям Закону «Про міждержавному використанні водних об'єктів, водних ресурсів і водогосподарських споруд Киргизької Республіки» в 2001 р Подібний характер співпраці з перенесенням на великі річки регіону знаходив підтримку Казахстану в питаннях виплати компенсації за використання гребель і водосховищ в Киргизстані. Однак такий варіант абсолютно не влаштовує Узбекистан.
Киргизько-казахське співробітництво на сучасному етапі на різних рівнях є найбільш показовим прикладом в регіоні. І з усього розмаїття водних відносин в Центральній Азії, модель відносин Бішкека і Астани можна вважати найбільш перспективною для використання в інших басейнах регіону. До слова, грунтуючись на практиці Чу-Таласського співробітництва, був ініційований новий проект між Киргизстаном і Таджикистаном на річках Ісфара і Ходжабікірган. Більше того, незважаючи на якусь демонстративність двостороннього водного проекту, де за великим рахунком простежується ледь помітна нота політичного престижу, більш значущим чинником виступає саме усвідомлення і практика, усталені за час реалізації проекту.
травня 2012 року відбудеться перший офіційний візит Президента Киргизької Республіки А.Атамбаєва до Республіки Казахстан.
За роки незалежності Киргизстану, Казахстан вклав в економіку цієї країни понад $ 1 млрд.
За офіційними даними КР, в сучасній структурі економіки Киргизстану казахстанські інвестиції розміщені в такій пропорції:
а) Банківський сектор - до 60%.
б) Гірничодобувний сектор - 8%.
в) Водно-енергетичний - 10%.
г) Будівельний - 3%.