МІНІСТЕРСТВО ОСВІТИ І НАУКИ УКРАЇНИ
Федеральне державне автономне освітній заклад
вищої професійної освіти
ДАЛЕКОСХІДНИЙ федеральний університет
Курсова робота
Всередині-індивідуальна мінливість гена малої рибосомной субодиниці у осетрових риб амура Acipenser Schrenckii Brandt, 1869 і Huso Dauricus (Georgii, 1775)
Кафу Наталія Михайлівна
р. Владивосток
Зміст
осетровий риба секвенування псевдоген
Введення
1. Огляд літератури
1.1Біологія, молекулярна еволюція і філогенія осетрових риб
1.1.1Проісхожденіе і різноманітність
.1.2 островами риби Амура
.1.3 Гени ядерної 18S РДНК
.1.4 Узгоджена еволюція
1.2Краткая характеристика використовуваних методів і маркерів
1.2.1Полімеразная ланцюгова реакція
.2.2 Автоматичне секвенування ДНК з флуоресцентною міткою
2. Матеріали і методи
2.1Полученіе геномної ДНК
.2 PCR-ампліфікація 18S РДНК
.3 Клонування 18S pДНК
.4 Секвенирование послідовності 18S РДНК
.5 Обробка даних секвенування 18S РДНК
.6 Тести для псевдогенов
3. Результати та обговорення
4. Висновки
Список літератури
Введення
Загін Acipenseriformes (осетри і веслоноси) є давньою групою риб, веде своє походження з Юрського Періоду (Grande, Bemis, 1991). Важливими особливостями цієї групи риб є довга тривалість життя, можливість досягнення великих розмірів і повільне дозрівання. Широке використання осетрових у комерческих цілях призвело до їх масштабного вилову, що різко зменшило чисельність цих риб. В даний час весь рід включений у списки Міжнародної конвенції з рідкісним видам (CITES). Основними факторами зменшення чисельності осетрових риб є деякі біологічні особливості цих риб (насамперед повільне дозрівання, розмноження з проміжками в кілька років, міграції), забруднення і знищення природних місць мешкання і нерестовищ, будівництво дамб на нерестових шляхах і надмірний вилов (Krieger et al. , 2008; Ludwig, 2008).
Всі осетрові є полиплоидами (4n - 8n - 16n) і володіють великим (120-500) числом хромосом (Birstein et al., 1993; Fontana et al., 1999). Так само генетичні дослідження осетрових риб виявили деякі особливості, такі як, консервативний характер каріологіческій (Lanfredi et al., 2001), біохімічної (Khabarov et al., 2002) та молекулярної (de la Herran et al., 2001; Krieger, Fuerst, 2000) еволюції, а також множинність алелей гена ядерної 18S рРНК (Krieger, Fuerst, 2002; 2004), що робить цю групу особливо привабливою для всебічного вивчення. Ці фактори, возожность, з'явилися причиною відносно простий міжвидової і міжродової гібридизації, поглиблюються перекриттям зон нересту. Гібридизація робить систематику Acipenseridae досить заплутаною (Birstein, 2002).
Предмет нашого дослідження - рибосомная ДНК (рДНК) - класичний приклад генної дуплікації, який може бути використаний в якості моделі для тестування теорії узгодженої еволюції (Hillis, Davis, 1988; Hillis, Dixo...
