ирокі права глави уряду, зафіксовані в первинному тексті Конституції, поверталися прем'єр-міністру; повноваження президента придбали номінальний характер. Потім в інтересах уряду було прийнято ще кілька поправок до Конституції - В«чотирнадцята поправкаВ» забороняла перехід депутатів парламенту з однієї партії в іншу, тобто закріплювала провідні позиції ПМЛ; В«п'ятнадцята поправка В»обмежувала вплив Верховного суду на уряд.
Кабінету міністрів вдалося змінити керівництво Верховного суду на своїх прихильників. В«Запаморочення від успіхівВ» штовхнуло уряд на конфлікт з керівництвом армією, яке спочатку підтримувало виконавчу владу, але потім з незадоволенням стежило за невигідною для себе концентрацією влади в одному місці. Виникли суперечності між Наваз Шаріфом і начальником штабу армії генералом П.Мушаррафом переросли в конфлікт. Прем'єр-міністр спробував в жовтень 1999 р. зняти генерала з його поста, проте цього разу В«найшла коса на камінь В». Підтриманий військовими колами П.Мушарраф справив 10 жовтня 1999 переворот і став керівником Пакистану. Учетверте в Пакистані до влади прийшли військові.
Хоча реальна влада в країні була зосереджена в руках армійських командирів, проте форма їх правління істотно відрізнялася від усіх попередніх режимів; робилося це з тим, щоб послабити негативну реакцію в країні і світі на таке непопулярне в сучасному світовому співтоваристві дію. Не було введено, як завжди це робилося раніше, військовий стан, а лише надзвичайний. Тому не створювалася військова адміністрація з управління країною. Робота представницьких органів була припинена, але самі вони не були розпущені. З деякими обмеженнями продовжували діяти політичні партії. Конституція країни не була скасована, а лише тимчасово призупинена. Значну частину свого президентського терміну пробув на посту глави держави М.Р.Тарар, а генерал П.Мушарраф мав посаду В«голови виконавчої влади В»; лише в червні 2001 р. під тиском військових М.Р.Тарар В«ПередавВ» свої президентські повноваження П.Мушаррафа. p> Згодом для надання більшої законності процесу президентського становлення П.Мушаррафа в країні в квітні 2002 р. був проведений референдум про продовження його повноважень ще на п'ять років. На цей раз питання, в инесенний на голосування, був більш чітким і коректним, ніж у Зія-уль-Хака в 1984 р. Він був сформульований так: В«Чи хочете Ви, щоб Первез Мушарраф залишався президентом протягом наступних п'яти років і працював для зміцнення місцевих органів влади, відновлення демократичного суспільства, продовження реформ, позбавлення від міжрелігійної ворожнечі і екстремізму та втілення в життя ідей засновника держави - Мухаммада Алі Джини? В» 11 . Мабуть, для того, щоб заповнити В«релігійний пробіл В»у питанні, П.Мушарраф напередодні референдуму оголосив своїм завданням будівництво В«демократичної держави на принципах ісламуВ» 12 . Рішення про референдум викликало досить сильну опозицію з боку тієї части...
