Теми рефератів
> Реферати > Курсові роботи > Звіти з практики > Курсові проекти > Питання та відповіді > Ессе > Доклади > Учбові матеріали > Контрольні роботи > Методички > Лекції > Твори > Підручники > Статті Контакти
Реферати, твори, дипломи, практика » Курсовые обзорные » Оптимізація методу придушення експресії гена EGFP З використанням кон'югатів антисмислового олігонуклеотиду і пірену

Реферат Оптимізація методу придушення експресії гена EGFP З використанням кон'югатів антисмислового олігонуклеотиду і пірену





гетеродуплекса також користуються правилом В«найближчого сусідаВ» і розраховують її за допомогою відповідних програм.

Експериментально можна знайти ефективну константу швидкості k eff брутто-реакції перетворення мРНК M в умовний продукт X (ця умовність НЕ впливає на результат кінетичних розрахунків, але значно їх спрощує):


В 

Ефективна константа швидкості брутто-реакції показує спостережувану швидкість розщеплення мРНК-мішені.

Механізм реакції можна представити наступною схемою:


В 

У цій схемі E - фермент РНКаза H, HE - проміжний комплекс її з субстратом H, K 1 - константа асоціації гетеродуплекса, що розраховується за формулою (3).

Для даної кінетичної схеми можна скласти систему кінетичних рівнянь:


В 

де С A - концентрація речовини A, k i - константа швидкості i-й елементарної реакції.

Зазвичай вимірюваним параметром є концентрація мРНК в розчині (вихідна C M0 і поточна C M ), тому k eff вважають відносно до матриці:


В 

Використавши квазістаціонарне наближення по проміжному продукту HE і спростивши вираз для швидкості реакції w за допомогою рівняння Міхаеліса - Ментен:


В 

де - константа Міхаеіса, можна перетворити вираз для швидкості зміни концентрації гетеродуплекса H:


В 

Знайдемо вираз для ефективної константи швидкості розщеплення мРНК-мішені в двох випадках: коли процес лімітується зв'язуванням мРНК антисмислового ODN і лімітується каталітичним розщепленням мРНК-мішені у складі гетеродуплекса.

Випадок 1. Лімітування гібридизацією. p> У цьому випадку процес розщеплення йде значно швидше, ніж гібридизація. Тому можна допустити припущення про встановлення стаціонарної концентрації гетеродуплекса H, тобто:


В 

З іншого боку, легко побачити (6), що:


В 

тому:


В 

Тобто, в даному випадку вираз для швидкості розщеплення мРНК збігається за абсолютним значенням з виразом швидкості реакції (швидкості утворення умовного продукту Х). Скориставшись цим, перетворимо вираз для швидкості зміни ко нцентраціі олігонуклеотиду, ми побачимо, що його концентрацію можна вважати практично незмінною:


В 

Скориставшись виразом (14) і, як наслідок, нехтуючи внеском члена k-1Сh в знаходимо швидкість розщеплення мРНК в новому вигляді і висловлюємо keff.


В 

Ви...


Назад | сторінка 10 з 25 | Наступна сторінка





Схожі реферати:

  • Реферат на тему: Цифровий прилад для вимірювання швидкості переміщення і концентрації СО в п ...
  • Реферат на тему: Характеристика процесу альтернативного сплайсингу МРНК еукаріот
  • Реферат на тему: Рівняння рівноваги. Проекція швидкості точки
  • Реферат на тему: Анексія Криму, як можна вірішіті Конфлікт України с Россией чі можна его ві ...
  • Реферат на тему: Синтез регулятора швидкості