Сенатори володіли рівними правами і повинні були приймати рішення колегіально. З плином часу Сенат зазнав ряд структурних та функціональних змін, залишаючись аж до 1917 року вищим адміністративним, судовим, контрольним, касаційним органом Російської імперії.
В указі царя, випущеному 27 квітня 1722 Про посаду Сенату детально встановлювався порядок організації ведення справ у цій установі. Справа спочатку уважно слухалося, потім обговорювалося. Питання вирішувалося за допомогою голосування. Ті справи, ... які вершаться, ... було наказано ... записавши в протокол, відзначати в реєстрі. Секретар записував висловлювання членів Сенату по кожному з обговорюваних питань, а члени Сенату закріплювали їх своїми підписами.
Сенат підкорявся строгим принципам колегіальності. Без згоди всього Сенату, ніщо робити не личить ... Строго каралося, що ... в Сенаті жодна справа не вести словесно, а все письмово ... Отже, Сенат був більш досконалим, ніж Боярська Дума органом, який має сувору регламентацію своєї роботи.
Діловодством в Сенаті відала Канцелярія. Вона була організована за аналогією з канцеляріями колегій. В указі від 19 лютого 1719 Про організацію канцелярії Сенату за зразком Державних Колегій визначався її складу: Бути в Сенаті нижнім чинам проти інших Колегій, з дяків сенатських Секретарями і управляти справи Секретарю одному ..., Да перекладачеві одному, нотаріусу з піддячих, актуаріуса з подьячих само, реєстраторам, канцеляристам.
На чолі Канцелярії стояв обер-секретар. У ту канцелярію повинні всі губернатори і воєводи писати яко про розпочату якої війни, мору, які зауваження до наказів. У Канцелярію надходили і чолобитні, якими відав рекетмейстер. Державні справи, які вирішуються в Сенаті, закріплювалися підписом сенатського обер-секретаря, який відав Канцелярією і державною печаткою.
Керівництво Сенатом здійснювалося генерал-прокурором Сенату. Його посада була введена Петром I в 1722 році і регламентувалася указом Про посаду генерал-прокурора від 27 квітня того ж року. У ньому визначалися головні функції та обов'язки генерал-прокурора: Генерал-прокурор повинен сидіти в Сенаті і дивитися міцно, щоб Сенат свою посаду зберігав у всіх справах, які сенатського розслідуванню підлягають, істинно, ревно і порядно, виконував свою посаду за регламентам і указам, записував дати указів і їх вміст у спеціальний журнал, а також вказував в ньому було чи справа виконано чи ні. Також генерал-прокурор здійснював нагляд за діяльністю всіх урядів місць в імперії. Його знаряддями були підлеглі йому фіскали з обер-фіскалами на чолі. Він отримував від фіскалів донесення, які був зобов'язаний виставляти на обговорення в Сенаті. Генерал-прокурору також підпорядковувалася Канцелярія з двома обер-секретарями, доданими йому в помічники.
Фіскали. Разом з установою Сената було установа фіскалів. Головний фіскал на всю державу називався обер-фіскалом. Він повинен був надсматрівать таємно і провідувати: чи упущень і зловживань у зборі скарбниці, не робиться чи де неправий суд, і за ким помітить неправду, хоча б і за знатним особою, має оголосити перед Сенатором; якщо донос виявиться справедливим, то одна половина штрафу, що стягується з винного, йшла в казну, а інша надходила на користь обер-фіскала за відкриття зловживання. Під відомством обер-фіскала були провінціал-фіскали, з такими ж обов'язками і правами в провінціях як і обер-фіскал в цілій державі. Під владою останніх складалися городові фіскали. Фіскали повинні були над усіма надсматрівать; всі повинні були всіляко їм сприяти - все, заради власної користі, запрошувалися до «доноснічеству».
Расправная палата і Сенатська контора. Однак, в подальшому, з огляду на те, що Сенат був вищим загальнодержавним установою, мали виключно широке поле діяльності, виникла потреба у створенні допоміжних органів. Вони повинні були допомагати Сенату у виконанні його функцій. Таким чином, структура Сенату складалася поступово. У його складі сформувалося два відділення: Расправная палата - по судових справах і Сенатська контора - з питань управління.
Сенатори касаційних департаментів не можуть займати жодної іншої посади на службі державною чи громадською. З Сенаторів частина призначається до прісутствованію в департаментах, частина присутня лише у загальних зборах, частина зовсім звільнена від будь-яких занять з Сенату. До числа останніх звичайно належать вищі сановники, члени госуд. ради, міністри та ін. п. Головну роботу несуть на собі Сенатори, присутні в департаментах. Оскільки державне і політичне становище установи обумовлюється суспільним становищем його членів, положення Сенату залежить саме від цих Сенаторів, присутніх в департаментах. Це - майже завжди особи, що займали посади III, іноді IV класу, причому призначення їх у Сенат є вінцем їх службової...