ір став називатися Земляні містом.
На початку XVII ст. Земляний місто було оточене дерев'яними стінами з 24 вежами; Рубаний місто також відновив дерев'яні укріплення, до складу яких входило 12 веж. Всі ці стіни і вежі згоріли в середині XVII ст. Крім укріплень згоріли три монастирі, 29 церков, торгові ряди і близько 1500 дворів. Після пожежі дерев'яні стіни не відновлювалися, але вали були підвищені, рови поглиблені. Замість дерев'яних веж на тих же місцях були побудовані в Земляному місті кам'яні вежі - дванадцятеро глухих і чотири проїзні: Знаменська, Семенівська, Волзька і зелейний.
Згорілі дерев'яні стіни Рубленого міста після пожежі практично не поновлювалися. Як і в Земляному, були побудовані тільки кам'яні башти на земляному валу - дві глухі і одна проїзна - Нікольська. На цьому роботи з відновлення кремля були зупинені і більше не продовжувались за відсутністю коштів, а зміцненню цієї найдавнішої частини міста більш не надавали великого значення, хоча кремль в XVII ст. залишався центром міста. Ще в 1501 р тут був побудований кам'яний Успенський собор.
Найбільш укріпленою і представницької частиною міста вже на рубежі XVI-ХVII ст. став Спаський монастир, розташований біля стін посада. У XVII ст. Монастир в Ярославлі володів значною територією головним чином у західній частині міста вздовж дороги на Углич, де в XVII ст. сформувалися монастирські слободи - Спаська, Богоявленська та ін. (всього понад 300 дворів). У результаті Спаський монастир зі своїми володіннями став значною силою, що впливала на соціальну та господарське життя Ярославля. До середини XVII ст. Спаський монастир, отримавши нові кам'яні стіни, сформувався в закінчений і найзначніший за масштабом ансамбль міста.
Посад, обнесений валом і кам'яними вежами, в XVII ст. став осередком кам'яних церков. До кінця сторіччя в кордонах Земляного міста були відбудовані в цеглі Афанасьевский і Казанський монастирі і 14 парафіяльних храмів. До цього ж часу колишні дерев'яні церкви були замінені кам'яними і на території Рубленого міста, і в слободах. Це підтверджує, що об'ємно-просторова структура міста в основному вже визначилася дерев'яною забудовою XVI - початку XVII ст. Всього в місті до кінця XVII ст. було споруджено близько 50 кам'яних храмів. Здійматися над рядовими будівлями, вони підкреслювали сформовану систему домінант, вносячи в неї новий масштаб і характер, акцентуючи виразніше ландшафтні особливості та основні структурні елементи міста, його провідні напрямки та композиційні вузли.
На старих зображеннях Ярославля XVII-XVIII ст. добре проглядається прийом, при якому ланцюжками храмів завершуються високі береги річок. Ці ланцюжки близьким по ритму кроком слідували у двох напрямках - вздовж берегів Волги і Которосли, маючи початок в соборному Успенському храмі міста, висунутому на саме вістря мису стародавнього кремля. І якщо частина цих пам'яток по березі Волги виявилася втраченої або забудованої пізніми будівлями, то з боку Которосли система прибережних храмів XVII в. збереглася краще. Разом з ансамблем Спаського монастиря вона свідчить про значення, яке надавалося цього фасаду міста з боку Московської дороги. Храми (Миколи Рубленого, Спаса на Місту, Михайла Архангела та ін.) Були поставлені на високих точках рельєфу і в органічному зв'язку з особливостями ландшафту, найчастіше займаючи його мисів ділянки і акцентуючи важливі функціональні вузли цій частині міста південний в'їзд через зелейний вежу (церква Спаса на Місту), Михайлівські ворота (церква Михайла Архангела) та ін. З розвитком слобід на захід від Спаського монастиря ланцюжок церков по лівому березі Которосли продовжилася (храми Богоявлення, Дмитра Солунського, Петра Митрополита, Миколи Мокрого та ін.), а монастир став важливим композиційним центром, об'єднуючим ланцюжка берегових храмів річки Которосли, що простиралися по обидві сторони від монастирського ансамблю.
Помітне згущення вертикалей храмів у напрямку до рубаним місту не тільки відзначало зону культового та адміністративного центру міста, а й знаменувало собою місцезнаходження торгового ядра Ярославля, його діловий центр. Територія торгу, займаючи майже чверть всієї площі Земляного міста, тягнулася від Волги до церкви Спаса на Місту і простягалася частково на території, що примикає до Спаського монастиря. Однак торгівля йшла і за межами Земляного міста: на північ від монастиря уздовж Углицької вулиці і особливо між монастирем і рубаною містом, де великі площі були зайняті м'ясними та рибними рядами. Торгова площа в Земляному місті з'єднувалася з Волгою і Которослью воротами волзькими і зелейний. Основні причали торгових суден перебували в гирлі Которосли і, отже, тут, з боку зелейний вежі, йшли найбільш інтенсивні торговельні пересування.
Кам'яну надбрамну вежу, поставлену, як і Волзька вежа, на дні Мед...