реакцій цього блоку, призначена для докладного опису систем, що включають фактори VIIa-TF, X, Xa і TFPI. Позначення системи: S, фактор X; E, VIIa-TF; P, фактор Xa; I, TFPI. br/>
(69)
(70)
(71)
(72)
(73)
(74)
(75)
(76)
(77)
(78)
Система рівнянь (69-78) виписана у відповідності зі схемою Рис. 5, що включає всі гіпотетичні реакції, які буде обговорюватися нижче. p> Критерії вибору величин констант. Значення констант, використані в розрахунках, і джерела інформації про ці константах підсумовані у Таблиці 2. Нам не вдалося знайти інформацію про деякі константах. Обговоримо трохи докладніше критерії вибору значень для цих констант. p> Реакція активації фактора Х комплексом VIIa-TF розглядалася, як протікає по двокрокового схемою Міхаеліса-Ментен з додаванням стадії фермент-продуктного комплексу. Ми не знайшли літературних даних про кінетичних константах освіти фермент-субстратного комплексу. Якщо відома кінетична константа асоціації, то, виходячи з = 435 хв-1, = 238 нМ, можна знайти його константу дисоціації зі співвідношення:
=
З того ж співвідношення випливає, що
2 нМ-1хв-1
Варіювання констант (дані не показані) показало, що для експериментів з характерними часом близько секунд і більше, варіювання значення від 2 нМ-1хв-1 до 10 нМ-1хв-1 і вище не впливає на кінетику системи. Тому ми поклали її рівною = 5 нМ-1хв-1, на підставі [43] Це призводить до значення
== 770 хв-1.
Константи освіти фермент-продуктного комплексу Xа-VIIa-TF (,) також не були виявлені в літературі. Однак, було показано, що фактор Xa, зв'язується з VIIa-TF зі спорідненістю, лише трохи меншим, ніж фактор X [19]. Це можна вважати переконливим свідченням на користь того, що Xa утворює з VIIa-TF комплекс, дуже схожий на комплекс X-VIIa-TF. Тому моделювання вироблялося при значеннях констант (,), рівних значень (,). p> Значення констант гіпотетичних реакцій: взаємодії фермент-продуктного комплексу з TFPI, асоціації Xa-TFPI і VIIa-TF з утворенням проміжного інгібіторного комплексу, і внутрішньомолекулярного перегрупування інгібіторного комплексу були підібрані так, щоб описати результати експериментів з роботи [18] (См . Рис 6).
Необхідно відзначити, що насправді константи взаємодії Xa і TFPI, вимірювані в експерименті і наведені в [18], не є істинними константами а ефективними. Якщо гіпотетичний шлях, досліджуваний у цій моделі, існує, то виміряні значення складним чином залежать від істинних констант взаємодії Xa, VIIa-TF і TFPI -,,,, і. Наприклад, у першому наближенні
= +
Спостережувані і невеликі. Зважаючи на це не буде великою помилкою вважати істинні константи утворення кінцевого комплексу рівними спостережуваним значенням, а константи гіпотетичних реакцій знайти окремо. p> Реакція інгібування X-VIIa-TF комплексом Xa-TFPI бу...
