і радгоспах.
Відповідно з новими завданнями, що встали перед країною, були змінені навчальні програми, введені нові предмети, пов'язані з наближенням навчального процесу до вимог військового часу. З урахуванням профілю факультетів вивчалися балістика, аеродинаміка літаків, військова топографія, хімія отруйних речовин. Викладачі гуманітарних дисциплін стали приділяти більше уваги питанням патріотизму, викривали агресивну сутність імперіалізму, готували студентів до політико-освітньої роботі в Червоній Армії. У Башкирському педагогічному інституті читалися лекції з курсів «Військове минуле російського народу», «Історія дипломатії», «Історія Башкирської АРСР». У медичних інститутах особлива увага зверталася на вивчення військово-польової хірургії, військової епідеміології. Студенти шефствовали над шпиталями, проходили практику, брали участь у хірургічних операціях. Для всіх вузів була розширена програма курсу «Основи марксизму-ленінізму»: у неї введені ленінські праці з військових питань, документи, що відображали діяльність партії по організації відсічі ворогу. З квітня 1942 року в вузах почалося викладання курсу політичної економії, на третьому курсі вивчали курс «Велика Вітчизняна війна Радянського Союзу».
Постановою ДКО від 17 листопада 1941 для студентів вузів була введена 110-годинна програма загального військового навчання (всевобуча). У серпні 1941 року була затверджена нова програма фізичної підготовки студентів, що була частиною військової підготовки. Студенти об'єднувалися в групи протиповітряної і протихімічного оборони, санітарні дружини, у ряді вузів функціонували курси медичних сестер.
коммуністичні партія і Радянський уряд вживали заходів щодо поліпшення роботи ВНЗ. 5 травня 1942 ЦК ВКП (б) і РНК СРСР прийняли постанову «Про план прийому до ВНЗ в 1942 році та заходи щодо зміцнення вищих навчальних закладів». У вузи приймалися без іспиту відмінники і особи, що закінчили середні школи в 1941 і 1942 роках з відмітками «добре» і «відмінно». РНК СРСР у постанові від 18 липня 1942 попередив працівників ВНЗ про неприпустимість скорочення термінів навчання. У 1943-1944 роках було прийнято постанови про встановлення стипендії всім успішним студентам вузів, про зміцнення навчально-матеріальної бази інститутів, про звільнення від призову в армію студентів 87 вузів і студентів останніх курсів усіх вузів. З 1 березня 1943 встановлювалося постачання студентів продовольчими товарами за нормами робочих і службовців. Вживалися заходи щодо збереження контингенту студентів, зміцненню навчально-матеріальної бази вузів і технікумів. За вказівкою Башкирського обкому ВКП (б) з 1942-1943 навчального року при вузах Башкирії були створені підготовчі відділення. Надійшли на ці відділення виплачувалася стипендія, надавалося місце в гуртожитку. Ці заходи і зростання числа вузів за рахунок евакуйованих привели до збільшення числа студентів. До початку 1945-1946 навчального року у вузах республіки (включаючи заочників) навчалося - 6,1 тис. осіб тобто в 2 рази більше, ніж до війни.
У республіці працювали 7 вищих навчальних закладів - Башкирський державний педагогічний та вчительський інститути, Башкирська державний сільськогосподарський інститут, Башкирський державний медичний інститут, Уфимський авіаційний інститут, Уфимський філіал нафтового інституту ім. Губкіна, Стерлитамакский і Бирский вчительські інститути.