для багатьох найважливіших областей біохімічних досліджень, наприклад, при вирішенні завдань типу В«структура-фармакологічна активністьВ», часто в таких дослідженнях методи комп'ютерної хімії доповнюються методами моделювання, специфічними для молекулярно-біологічних систем.
У період становлення та формування в самостійну область новий науковий напрям нерідко отримує різні назви у різних авторів. Так сталося і з комп'ютерною хімією: історично закріпилися дві назви - В«комп'ютерна хімія В»таВ« математична хімія В». Так, один з наукових журналів, котрий надав значний вплив на становлення комп'ютерної хімії, називається В«Journal of Mathematical Chemistry В». Проте назва В«математична хіміяВ» представляється невдалим, якщо врахувати, що багато галузі хімії, що сформувалися задовго до появи комп'ютерної хімії, спочатку були засновані на математичному фундаменті, наприклад, фізична хімія, кінетика і каталіз, квантова хімія. При тому, що ряд основоположних робіт в комп'ютерній хімії був виконаний під час ЕОМ перших поколінь, розвиток комп'ютерної хімії стало можливим тільки з появою сучасних комп'ютерів. Незважаючи на те, що сьогодні комп'ютери використовуються практично у всіх галузях сучасної хімії як для теоретичних так і для експериментальних досліджень, саме комп'ютерна хімія набагато більше багатьох інших областей хімії залежить від рівня розвитку комп'ютерних технологій. Така залежність пов'язана насамперед зі специфікою найважливіших алгоритмів теорії графів, багато з яких мають експонентну обчислювальну складність - теоретична оцінка часу, витраченого на виконання алгоритму, є експоненціальною функцією від розміру графа, тобто від кількості його вершин і ребер, або кажучи общехимической мовою - від числа атомів і хімічних зв'язків в молекулі.
З іншого боку, багато завдань хімічної інформатики, які вирішуються за допомогою методів комп'ютерної хімії, вже по своїй постановці неможливі без використання комп'ютера, наприклад, формування та експлуатація комп'ютерної бази даних за властивостями хімічних сполук. Необхідно при цьому зазначити, що сама хімічна інформатика виникла задовго до появи комп'ютерів. Так, були і продовжують широко використовуватися численні хімічні довідники та реферативні журнали, видрукувані на папері. Існують зарекомендували себе і стали класичними методи пошуку за цим виданням із застосуванням всіляких друкованих покажчиків (авторського, предметного, формульного і т. д.), організовувані без залучення апарату комп'ютерної хімії. Таким чином, в відміну від комп'ютерної хімії, хімічна інформатика, як і переважна більшість традиційних областей хімії, заснована на застосуванні докомпьютерную технологій. У цьому і полягає основна методологічне відміну комп'ютерної хімії. З певною часткою неточності можна стверджувати, що якщо метою більшості хімічних досліджень є встановлення деяких хімічних закономірностей, то метою до...
