членом Средазбюро ЦК ВКП (б). p> У 1925-27 - заст. голови (за іншими даними - заст. Секретаря) ВЦВК, зав. відділом національностей при Президії ВЦВК, член Президії ВЦВК.
21.5.1925 - 1927 - секретар Ради Національностей ЦВК СРСР.
У 1927 по 1928 рр.. був ректором Московського інституту сходознавства ім. Н.Наріманова і професором 1-го МГУ. Одночасно, заступник директора, директор Науково-дослідного інституту етнічних і національних культур народів Сходу СРСР при ЦВК СРСР і член Всесоюзного центрального комітету нового алфавіту, а в лютого 1927 року був членом Тимчасової президії Всесоюзного комітету ново-тюркського алфавіту.
У 1928-1931 - ректор Казахського педагогічного інституту і, одночасно, зав. кафедрою історії КазПІ. p> 19 червня 1929 Бюро - затверджений членом колегії НК Проса КАРСР.
22 верес. 1929 Секретаріат - Затверджено членом колегії відділу Агітації, пропаганди і друку Казкрайкома ВКП (б). p> 30 Окт. 1929 - Секретаріат - додатково мобілізований на хлібозаготівлі до Актюбинский округ. p> З 1930 - перед. Центрального бюро краєзнавства Казахстану. p> В Алма-Аті відбувся Перший (і останній) Всеказахстанскій краєзнавчий з'їзд. Головою Центрального бюро було обрано відомого історика Санджар Асфендіяров. Однак, з'їзд виявився не созідатальним, а репресивним. В«Історична наука подібна оркестру, керованого диригентом. Природно, ніякої самодіяльності у такому колективі бути не може. Інша справа, краєзнавство, коли кожен самостійно копає з глибин минулого те, що його душі, моралі, совісті завгодно, але що буває безсторонньо керівництву країни. Тим більше, в Країні Рад, де було дозволено крокувати тільки наміченим компартією курсом, жити, немов за статутом вартової служби; над чим сміятися і що любити дозволялось директивами згори В»
2 лютого 1931 Секретаріат - призначений директором Казахського Медичного Інституту. p> У 1931-1933 рр.. - народний комісар охорони здоров'я Казахстану, а також ректор Медичного інституту.
4 квітня 1933 С. Асфендіяров був затверджений (на прохання Президії АН СРСР) керівником історико-археографічної комісії Казахського філії АН СРСР, вважати цю роботу основної.
У листопаді 1933 - затверджено заступником Наркома освіти, а також став начальником управління університетів, науки і бібліотек Казахстану. Через рік, 25 червня 1934 - звільнений від заст. НК Проса. p> У 1933-37 - заст. перед. Казахського відділення АН СРСР, зав. відділом історії НДІ національної культури, професор кафедри історії КазПІ ім. Абая. p> 27 вересня 1937 Бюро Алма-Атинської міськкому виключений з партії, тому що "Викрито як контрреволюціонер-націоналіст і заарештований органами НКВС ".
Проходив по справі "про японської шпигунської мережі ". 29 вересня 1937 в "Казахстанської правді "було опубліковано лист студентів Казахського інституту марксизму-ленінізму з заголовком "Японська шпигун в ролі історика". У ньому вони викривали професора С.Д. Асфендіярова за його нібито націоналістичні, пантюркістських погляди, за те, що "фашистський наймит Асфендіяров свою контрреволюційну пачкотню черпає з фашистських джерел ".
У 1934-1937 роки - завідувач історико-археографічної комісією Казахського філії Академії наук СРСР, заступник голови Казахського філії Академії наук СРСР, завідувач відділом історії Науково-дослідного інституту національної культури при КазЦІК, професор кафедри історії Казахського педагогічного інституту.
Державний та громадський діяч, організатор науки і педагог, С. Асфендіяров в 1937 році був незаконно репресований. Не оминули сталінські репресії та його дружину Рабіг. Коли був репресований її чоловік, Рабіг потрапила в табір АЛЖИР для дружин репресованих. Народна поголоска стверджує, що це був самий зразковий по всіма параметрами табір - кожна жінка робила все можливе для того, щоб через неї не погіршилося становище чоловіка. Таких були тисячі жінок. Разом зі усіма пройшла всі жахи табору і Рабіг.
В«Після реабілітації Рабіг Лапіна так і не повернулася в Алма-Ату - репресованим заборонялося жити у великих містах (чи вдалося їй побувати в рідному Петербурзі, з яким пов'язано так багато дорогих серцю спогадів?). В Алма-Ату в кінці 50-х приїжджала дочка Асфендіярова Адол - держава обіцяла відновити спадкоємців у їх майнових правах. Але нічого в їх зруйнованому будинку виявити не вдалося. Пропала і багата бібліотека Санжара Асфендіярова, конфіскована з усім майном у 1937 році В».
Враховуючи значний внесок С. Асфендіярова в державну, наукову і громадську діяльність та у розвиток освіти і охорони здоров'я в Республіці Казахстан, Рада Міністрів Казахської РСР 11 січня 1989 прийняв Постанову про присвоєння його імені Алматинському державному медичному інституту.
Пам'ять про нього в Алмати увічнена назвою вулиці; на будівлі по вулиці Толі бі, 29, де жив учений, встановлена ​​меморіальна дошка.
З 1993 року, щороку, 31 серпня у Казахста...
