ратегічно важливих сировинних товарів став проводитися без реєстрації відповідних підприємств-експортерів в МЗЕЗ.
Завершений перехід до нового внешнеторговому режиму був з прийняттям федерального закону від 7 липня 1995 № 157 Про державне регулювання зовнішньоторговельної діяльності raquo ;. У ньому крім визначення принципів державного регулювання зовнішньоекономічної діяльності були розмежовані сфери компетенції Федерації і її суб'єктів при здійсненні ЗЕД, а також перераховані найважливіші функції федеральних виконавчих органів, відповідальних за регулювання даної сфери діяльності.
З квітня 1996 ліквідовано переважна кількість експортних мит. Поряд з цим були скасовані обов'язкова експертиза кількості, якості і ціни товарів, а також реєстрація експортних контрактів (обов'язковий характер був замінений на рекомендаційний). Контроль за експортом збережений тільки в сфері повернення валюти за зовнішньоторговельними операціями.
У цьому ж 1996 р введений валютний контроль за імпортом (за аналогією з експортом). Його мета - перешкодити використанню імпортних контрактів для нелегального вивезення російського капіталу. При цьому валютним контролем були охоплені також бартерні угоди.
Діюча законодавча база потребувала розвитку і вдосконаленні. Важливим напрямком досконалістьвання російського зовнішньоекономічного законодавства було його приведення у відповідність з міжнародними нормами.
В кінці 1990-х років була зроблена чергова спроба створення реально функціонуючого наднаціонального органу. 26 лютого 1999 Білорусь, Казахстан, Киргизстан, Росія і Таджикистан підписали Договір про ТЗ і Єдиному економічному просторі. 23 травня 2000 Міждержавна рада п'ятірки прийняв рішення по формуванню на базі ТС міжнародної економічної організації, наділеної функціями, пов'язаними з вступом до Світової організації торгівлі, формуванням митних кордонів і єдиної зовнішньоекономічної політики. 10 жовтня того ж року в Астані президенти Білорусі, Казахстану, Киргизстану, Росії і Таджикистану підписали Договір про заснування Євразійського економічного співтовариства (ЄврАзЕС). Згідно з Угодою організація створювалася для ефективного просування процесу формування МС і ЄЕП ЄврАзЕС.
Другий етап розвитку зовнішньоторговельної діяльності можна визначити періодом з 2001 по 2011 рр. Перші роки існування ЄврАзЕС показали, що жодна з держав-членів не збиралося узгоджувати свою зовнішньоекономічну політику з іншими учасниками Договору, що ясно проявилося на переговорах про вступ даних країн до СОТ, яка відіграє провідну роль у регулюванні світової торгівлі. СОТ - це міжурядова міжнародна організація у сфері міжнародної торгівлі, що розробляє її основоположні принципи і норми.
СОТ передбачає ряд специфічних юридичних зобов'язань, що регулюють зовнішньоторговельну політику держав-членів. Основоположними принципами, що лежать в основі угод СОТ, є недискримінація, взаємність, транспарентність (прозорість), лібералізація торгівлі, застосування спеціальної допомоги і поступок країнам, що розвиваються, що зв'язують і підлягають виконанню зобов'язання, а також запобіжні механізми (safety valves).
Недискримінація проявляється в таких принципах, як режим найбільшого сприяння і національний режим. Обидва ці принципи закладені в основних правилах СОТ щодо товарів, послуг та інтелектуальної власності, але в кожній з цих областей мають різну сутність і сферу застосування.
Слід зазначити, що участь у МС припускає узгодження заходів тарифної підтримки з усіма державами, що входять в нього. На переговорах про приєднання до СОТ жодна країна не погоджувала свої тарифи з іншими учасниками. Крім того, державами не була вироблена чітка позиція з питання приєднання до цієї організації всіх учасників ТС, не було прийнято остаточне рішення про те, яким чином відбуватиметься приєднання: чи буде кожна країна вступати самостійно, узгоджуючи при цьому свої позиції, або ж держави будуть вступати в рамках МС. З роками розбіжності не згладилися, сторонам не вдалося знайти компромісне рішення з принципових питань. Крім того, деякі країни не були зацікавлені в ефективному функціонуванні ЄврАзЕС. Так, в 2003 році на засіданні Міждержради Співтовариства білоруська делегація виступила з критикою програмного документа Пріоритетні напрямки розвитку ЄврАзЕС на 2003-2006 та наступні роки raquo ;. Виконуючий обов'язки прем'єр-міністра Білорусі Сергій Сидорський в ході засідання заявив, що інтеграційні процеси в рамках ЄврАзЕС, обумовлені цим документом, входять у суперечність з аналогічними процесами в рамках формування Союзної держави Росії і Білорусі, зокрема, у сфері запровадження єдиної валюти. До речі, питання про введення єдиної валюти ще не вирішене ні в рамках Союзної держави, ні в рамках Співтовариства.