Значні перешкоди створюються при неповному освоєнні бюджетних коштів та невиконанні програм.
Тут багато в чому позначається і проблема, яка пов'язана з недофінансуванням, тому що в цьому випадку виникає питання: як скорочувати витрати з фінансування окремих заходів програми? Кожний захід характеризується своїм порогом, при фінансуванні нижче якого воно неефективне: якщо ми вклали менше коштів, то це просто омертвлені кошти. Таким чином, якщо рівномірно по всіх програмним заходам починають скорочувати витрати, виходить, що частина заходів виконана, частина ні. У результаті різко знижується програмний потенціал цільової програми, тому що всі заходи в ідеалі між собою пов'язані, в результаті ми ніби викреслюємо, виключаємо важливі заходи, без яких інші заходи, навіть будучи завершеними і виконані цілком, є безглуздими. Так, обсяг коштів, передбачений в рамках крайової цільової програми у 2009 році на реалізацію заходів в області рекламно-інформаційної підтримки санаторно-курортного і туристичного потенціалу Краснодарського краю в цілях розвитку і вдосконалення інфраструктури курортів Краснодарського краю, а також з метою рекламно-інформаційного забезпечення туристичної діяльності був зменшений в 2 рази в порівнянні зі спочатку запланованим обсягом, що призвело до невиконання низки намічених заходів, зниженню потоку туристів і внаслідок - недоотримання податкових надходжень до крайового бюджету.
Кошти, виділені на виконання програми необхідно витрачати рівномірно. Раціональне використання коштів і достатнє фінансування програм призведе до більш ефективного виконання програм, а значить до планового вирішення проблем розвитку території. При недостатності коштів можливим було б залучити приватний сектор у проведення заходів програм, задіяти установи вищої освіти. Також рівномірне і своєчасне виконання заходів дасть можливість зменшити відсоток неосвоєних коштів наприкінці періоду реалізації заходів.
Розробка чітких, цільових критеріїв для кожної програми є необхідною умовою ефективного управління та контролю за її реалізацією. Це складна методологічна завдання, оскільки кожна програма має свої конкретні цілі і відповідні цільові показники.
Для оцінки не тільки кількісної, але і якісної сторони проведення заходів слід брати до уваги такий показник, як збереження високої якості навколишнього середовища. Враховувати не тільки позитивні результати від заходів, а й негативні або залишилися на тому ж рівні. При їх порівнянні буде отримана більш точна оцінка, яка дозволить виробити надалі шляхи вирішення проблем. Наприклад, при будівництві нових будинків враховувати не тільки, скільки було побудовано, але і скільки ще залишається в зруйнованому стані. Або при переробному виробництві враховувати не тільки, скільки було перероблено, припустимо відходів, але і скільки було вироблено за цей період.
При розробці критеріїв необхідно враховувати:
якість програми, зокрема, ясність стратегічного підходу та інноваційний характер цілей, пропонованих в ній до реалізації;
здійсненність програми та відповідність між поставленими цілями і доступними ресурсами;
очікуваний вплив на модернізацію та диверсифікацію регіональної економіки, створення довгострокових якісних робочих місць;
внесок приватного сектора в фінансування ...
