итуту "добре підірвуть мою и так вже доволі плоского кишеню ". Добові та відрядження оплачувати не поспішали ...
Напередодні нового 1929 вчений пише: "... Чую, як поволі та остаточно спускаюся на дно з боці здоровля ї інтелектуальної сили. Надто довго я державами молодим и тепер Надто Швидко старіюся ї Робл, як кажуть Гавуки (деті. - Ж.П.), справжній старенька. Наукова робота Йде мені дуже піняво - перешкоджають ... Різні бюрократічні заняття ї безліч ЗАСіДАНЬ, на Які треба ходити ... Колі моє здоров'я Трохи гіршає, все з острахів думаю, что то буде як задрих лаби. Гавуки просто здохнуть под плотом з голоду й холоду ".
Разом з тим в інституті почалися суперечки, вміло підігріті органами. Учнів професора налаштовують проти викладача, підмовляють їх вимагати для себе кращих посад, наукових звань. Рудницький не погоджується. І тоді в ОДПУ з'являється наклеп, підписаний у Зокрема і нареченим Ірини Рудницької Василем Бабяк. Професор пригнічений, і не тільки університетськими негараздами. Він знає про почався в республіці голодомор: в експедиціях бачив знищені села, померлих людей.
23 березня 1933 Степана Рудницького арештовують і рівно через півроку "за участь у контрреволюційній військовій організації і шпигунстві "засуджують до п'яти років заслання. Під час слідства він написав монографію "Геономія", а в "Свірлаге" - книжку "Ендогенна ДИНАМІКА земної кору". Обидві роботи забрало ОДПУ, і де вони, невідомо.
Встановлено, Степан Рудницький перебував у Біломоро-Балтійському таборі, працював на лісосплаві. Навесні 1935-го переведений на Соловки. Колишній співв'язнів Семен Підгайний згадував: "Місцем його (Рудницького. - Ж.П.) проживання стає так звана перша колона, сира, смердюча камера, куди ніколи не заглядало сонце, яке на острові ще й не частий гість. Нари з клопами, важкий, навіть гіркий від махорки повітря, тут же розвішені мокрі онучі, штани, бушлати, валянки, а навколо холод і голод ".
Рудницький був в інвалідному команді, через що сильно страждав від голоду, жахливого ставлення охорони. Проте "тримався цілком незалежно і ніколи не звертався ні з якими проханнями ні до якого керівництву, - він просто його ігнорував і вчив молодь географії ", пише С.Підгайний. p> У в'язниці професор Рудницький зустрів 36-річчя своєї наукової діяльності та 25 років - університетської професури. Визнання і всесвітня слава не врятували засновника української географії від розстрілу, до якого Степана Рудницького засудили вже після відбуття заслання.
2007 рік був проголошений на Тернопільщині Роком географа Рудницького