екула гемоглобіну В«АВ» складається з двох субодиниць одного типу і двох субодиниць іншого типу, тобто є тетрамером. Фіксуються четвертинні структури білків всіма типами слабких зв'язків, а іноді ще й дисульфідними зв'язками.
МЕТОДИ ВИЗНАЧЕННЯ ПЕРВИННОЇ СТРУКТУРИ БІЛКА
1) Деградація по Едмону
До розчину білка додають реактив Едмона, що містить фенілізотіоціанат.
Фенілізотіоціанат взаємодіє з альфа-аміногрупою першої (N-кінцевий) амінокислоти, а потім відбувається її відщеплення від поліпептидного ланцюга шляхом гідролізу:
В
Після цього ідентифікують першу амінокислоту. Потім процес повторюється. p> В даний час процес автоматизований.
2) Секвенування ДНК
Первинна структура будь білкової молекули безпосередньо залежить від структури ДНК-геному. Тому спочатку виділяють ген, в якому закодована структура білка. Далі визначають послідовність азотистих основ у ДНК. Кожна амінокислота в білкової молекулі закодована поєднанням трьох азотистих основ - кодонів (кодоном) в молекулі ДНК. Наприклад, поєднання трьох підстав аденіну (ААА) кодує амінокислоту фенілаланін, а послідовність з трьох підстав цитозину - гліцин. Це дає можливість отримати інформацію про первинну структуру білкової молекулі, а, значить, прогнозувати будову всієї молекули в цілому, оскільки саме первинна структура визначає будову всіх вищих рівнів організації - І вторинної, і третинної, а, іноді і четвертинної структур. p> Для перевірки припущень про будову вищих структур використовується ще один метод:
3) Рентгеноструктурний аналіз
Схема, яка пояснює принцип цього методу, представлена ​​на малюнку:
В
У результаті опромінення на фотоплівці фіксується карта електронної щільності (схожа на географічну мапу). Далі виробляється комп'ютерний аналіз отриманого зображення, в внаслідок чого будується просторова модель білкової молекули.
Електронна мікроскопія
Може бути використана для з'ясування структури білкових молекул з великою молекулярною масою - від 500.000 до 1.000.000 Так (дальтон). Дальтон (Так) і кілодальтон (кДа) - одиниці вимірювання маси білків. 1кДа = 10 3 Так. 1 дальтон дорівнює 1/16 маси атома кисню (киснева одиниця маси).
КОНФІГУРАЦІЯ І конформаціях білкових молекул
З усього сказаного можна укласти, що просторова організація білків дуже складна. У хімії існує поняття - просторова КОНФІГУРАЦІЯ - жорстко закріплене ковалентними зв'язками просторове взаємне розташування частин молекули (наприклад: належність до L-ряду стереоізомерів або до D-ряду).
Для білків також використовується поняття конформаціях білкової молекули - певне, але не застигле, що не незмінне взаємне розташування частин молекули . Так як конформація білкової молекули форм...
