ion - розгорнутий опис дослідження яке проводиться в даному експерименті.
ProtocolName - назва правила, за яким одні дані будуть перетворені в інші. Це поле задає ребро в ациклічному графі описує експеримент. Надалі значення буде використано як ідентифікатор в інших типах файлів описуваних форматом. p align="justify"> ProtocolType - тип правила перетворення даних (за класифікацією MGED).
ProtocolDescription - опис правила у вільній формі.
ProtocolParameters - список параметрів які використовуються правилом для виконання дії. Параметри перераховуються через крапку з комою. Надалі кожен параметр буде використаний як ідентифікатор. p align="justify"> ProtocolHardware - опис обладнання, яке використовується для виконання кроку експерименту при обробці даних за допомогою правила перетворення даних.
ProtocolSoftware - опис програмного забезпечення, яке необхідно застосувати для виконання кроку експерименту (наприклад для нормалізації даних).
SDRF File - список SDRF файлів пов'язаних з даними IDF файлом.
TermSourceName - список імен вхідних даних в подальшому використовуються як ідентифікатори.
TermSourceFile - файл, де вихідні дані записані або це може бути інтернет посилання (URL) на дані.
Comment [<ім'я визначається експериментатором>] - це поле використовується вбазамі даних для відображення іншої інформації задається експериментатором.
У IDF файлі кожне поле пишеться з нового рядка. Спершу йде ім'я поля, потім табуляція і значення поля. У разі, якщо поле має кілька значень, то значення повинні бути розділені символом табуляції. ПоляInvestigation Title, Date of Experiment, Public Release Date, Experiment Description должныиметьтолькооднозначение. p align="justify"> SDRF файл влаштований як таблиця значень: рядок у таблиці це послідовність кроків експерименту над одним джерелом даних. Стовпці в таблиці - дії, які виробляються над даними .. Причому вважається, що рядки впорядковані за часом. Тобто якщо джерела даних обробляються в певному порядку, то рядки у файлі повинні бути розташовані саме в цьому порядку. Перший рядок у файлі - рядок заголовок, решта - рядки значення. Значення у стовпці повинні відповідати заголовку. У заголовку поля групуються в секції. Секція складається з головного поля секції, після чого йде кілька підлеглих полів. Деякі поля можуть відповідати параметрам, які були визначені в IDF файлі. У цьому випадку пишеться ім'я поля з параметром та ім'я параметра в квадратних дужках, наприклад так: В«Characteristics [occupancy]В» Наведемо далі опис деяких секцій. p align="justify"> SampleName - ідентифікатор матеріалу з яким ведеться експеримент. Наприклад В«пробірка номер 234В»
? Characteristics [<назва характеристики>] - поле з арг...