Теми рефератів
> Реферати > Курсові роботи > Звіти з практики > Курсові проекти > Питання та відповіді > Ессе > Доклади > Учбові матеріали > Контрольні роботи > Методички > Лекції > Твори > Підручники > Статті Контакти
Реферати, твори, дипломи, практика » Курсовые обзорные » Модернізація бази даних про аналізи на ДНК мікрочіпах

Реферат Модернізація бази даних про аналізи на ДНК мікрочіпах





ументом. Якась характеристика матеріалу, характеристик може бути багато або вони можуть бути відсутні зовсім.

? Materialtype - вказівка ​​типу матеріалу з яким ведеться експеримент. Якщо це було РНК виділене з усіх клітин-якого організму, то в значення потрібно написати В«whole_organismВ». В цілому це поле повинно бути заповнене за класифікацією MGED.

? Description - вільне опис матеріалу.

? Comment [<ім'я коментаря>] - коментар до матеріалу, з додатковим зазначенням імені коментаря.

HybridizationName - назва способу, яким проводиться приєднання фрагментів молекул ДНК або РНК до молекул пришитим на підкладку мікрочіпа. В цілому це поле може бути наприклад ім'ям технології, наприклад В«AffymetrixВ» або В«IlluminaВ». p align="justify">? ArrayDesign REF - зовнішнє ім'я мікрочіпа, який застосовувався.

? Comment [<ім'я коментаря>] - коментар до мікрочипу і хімічному процесу.

Protocol REF - посилання на опис протоколу в IDF файлі.

? ParameterValue [<ім'я параметра>] - список параметрів був зазначений у IDF файлі. У SDRF файлі зберігаються значення.

? Performer - ім'я людини, який виробляв дію визначається протоколом.

? Date - дата проведення кроку експерименту.

? TermSource REF - посилання на зовнішній опис протоколу.

? Comment [<ім'я коментаря>] - типізований коментар.

ArrayDataFile, DerivedArrayDataFile, ImageFile - у значеннях цих полів повинні бути написані імена файлів. Файли відповідно зазначеним порядком це: необроблені дані з мікрочіпа, оброблені дані з мікрочіпа, саме зображення, яке було отримане при фотографуванні мікрочіпа. Однією рядку в SDRF файлі відповідає один файл. p align="justify">? Comment [<ім'я коментаря>] - типізований коментар.

ArrayDataMatrixFile, DerivedArrayDataMatrixFile - ім'я файлу, де можуть зберігатися дані з більш ніж одного мікрочіпа. Також як і в попередньому випадку один файл на одну сходинку SDRF файлу. p align="justify">? Comment [<ім'я коментаря>] - типізований коментар.

Звернемося тепер до тієї частини формату, яка описує дані самих мікрочіпів. Форматів зберігання даних мікрочіпів існує досить багато: Generic, Affymetrix, GenePix, Agilent, ScanAlyze, ScanArray, QuantArray, Arrayvision, Spotfinder, BlueFuse, UCSF Spot, NimbleScan, AppliedBiosystems, Code...


Назад | сторінка 8 з 23 | Наступна сторінка





Схожі реферати:

  • Реферат на тему: Мова SMS - що це таке. Бути чи не бути йому в нашому житті
  • Реферат на тему: Яким бути сучасному вчителю?
  • Реферат на тему: Учитель XXI століття. Яким він повинен бути ...
  • Реферат на тему: Сучасний підручник математики. Яким йому бути
  • Реферат на тему: Штучний інтелект: чи може машина бути розумною?