о ті повинні будуть виконати свій обов'язок перед своєю батьківщиною разом з усім народом. У разі початку війни вони повинні будуть ставитися до Росії як до ворога, але В«воювати з ворогами не означає ненавидіти їх, а тільки захищати свою батьківщинуВ». p align="justify"> лютого 1904 Японія розірвала дипломатичні відносини з Росією. Два священнослужителя, що працювали в той час у місії, повернулися додому. Духовенство та миряни японської церкви звернулися до свого єпископа з проханням залишитися в Японії. Єпископ Микола відповідав, що він вже прийняв перед Богом рішення залишитися в Японії, у своїй маленькій квартирці при соборі. В«Я сподіваюся, що оголошення військових дій не принесе з собою ніякої зміни в діяльності нашої церкви. Катехити продовжуватимуть проповідувати Євангеліє Спасителя, учні - відвідувати школу місії, а я сам віддамся цілком перекладу наших богослужбових книг ...
Сьогодні за звичаєм я служу в соборі, але відтепер надалі я вже не буду брати участі в громадських Богослужіннях нашої церкви ... Досі я молився за процвітання і мир Японської імперії. Нині ж, раз війна оголошена між Японією і моєю батьківщиною, я, як російський підданий, не можу молитися за перемогу Японії над моїм власним батьківщиною. Я також маю зобов'язання до своєї батьківщини і саме тому буду щасливий бачити, що ви виконуєте борг у відношенні до своєї країні В». У всі парафії японської православної церкви, стривожені оголошенням війни з Росією, було розіслано В«Окружне листаВ», в якому єпископ благословляв японських християн виконати свій обов'язок вірнопідданих, але нагадував: В«Кому доведеться йти в битви, не шкодуючи свого життя, боріться - не з ненависті до ворога, але з любові до ваших соотчичей ... Любов до батьківщини є святе почуття ... Але крім земної батьківщини у нас є ще вітчизну небесне ... Це батьківщину наше є Церква, якої ми однаково члени і по якій діти Отця Небесного дійсно складають одну сім'ю ... І будемо разом виконувати наш обов'язок щодо нашого небесного вітчизни, який кому належить ... І разом з тим будемо гаряче молитися, щоб Господь скоріше відновив порушений мир ... В»
Святитель припинив всіляку листування з Росією і цілковито присвятив себе перекладацькій роботі.
Коли в Японії стали прибувати російські полонені (загальна їх кількість досягала 73 тисяч), святитель Микола за згодою японського уряду утворив Товариство духовної розради військовополонених. Для окормлення полонених їм було відібрано п'ять священиків, що володіли російською мовою. Кожного полоненого, який прибув до Японії, японська церква, благословила срібним хрестиком. Полонені забезпечувалися іконами та книгами. Сам владика неодноразово звертався до них письмово. p align="justify"> Діяльність єпископа Миколая під час війни була вкрай високо оцінена не тільки в Японії, але і в Росії. Імператор Микола II писав єпископу Миколі наприкінці 1905 року: В«... ...