ї риболовецької ватаги Пугачов був наздоженуть Міхельсоном. Зрозумівши, що бою не уникнути, пугачовці вибудували бойові порядки. 25 серпня відбулося останнє велике бій військ під командуванням Пугачова з царськими військами. Бій почався з крупною невдачі - всі 24 гармати армії повсталих були відбиті кавалерійською атакою. У запеклому бою загинуло більше 2000 повстанців, серед них отаман Овчинников. Більше 6000 чоловік було взято в полон. Пугачов з козаками, розбившись на дрібні загони, бігли за Волгу. У погоню за ними були вислані пошукові загони генералів Мансурова і Голіцина, яицкого старшини Бородіна і донського полковника Тавінского. Не встигнувши до бою, побажав брати участь в затриманні і генерал-поручник Суворов. Протягом серпня, вересня більшість учасників повстання було спіймано і відправлено для проведення слідства в Яїцьке містечко, Симбірськ, Оренбург.
Пугачов з загоном козаків біг до Узень, не знаючи, що ще з середини серпня Чумаков, Творогов, Федулёв і деякі інші полковники обговорювали можливість заслужити прощення здачею самозванця. Під приводом полегшити догляд від погоні, вони розділили загін так, щоб відокремити відданих Пугачову козаків разом з отаманом Перфильевим. 8 вересня біля річки Великий Узень вони накинулися і зв'язали Пугачова, після чого Чумаков і Творогов вирушили в Яїцьке містечко, де 11 вересня оголосив про полонення самозванця. Отримавши обіцянки в помилуванні, вони повідомили спільникам і ті 15 вересня доставили Пугачова в Яїцьке містечко. Відбулися перші допити, один з них провів особисто Суворов, він же зголосився конвоювати самозванця в Симбірськ, де йшло основне слідство. Для перевезення Пугачова була виготовлена ??тісний клітина, встановлена ??на двоколісну гарбу, в якій закутий по руках і ногах, той не міг навіть повернутися. У Симбірську протягом п'яти днів його допитували П. С. Потьомкін, начальник секретних слідчих комісій, і граф. П. І. Панін, командувач каральними військами уряду.
Перфильев з його загоном були захоплені в полон 12 вересня після бою з карателями біля річки Деркул. У цей час, крім розрізнених осередків повстання, організований характер мали бойові дії в Башкирії. Салават Юлаєв разом зі своїм батьком Юлаем Азналіним очолював повстанський рух на Сибірській дорозі, Каранай Муратов, Качкин Самаров, Селяусін Кінзін на Ногайської, Базаргул Юнаев, Юламан Кушаев і Мухамет Сафаров - в Башкирському Зауралля. Вони сковували значний контингент урядових військ. На початку серпня був зроблений навіть новий штурм Уфи, але в результаті слабкої організації взаємодії між різними загонами, він склався невдало. Тривожили набігами на всьому протязі прикордонної лінії казахські загони. Губернатор Рейнсдорп доповідав: башкирцев і кіргізци НЕ усмиряются, останні щохвилини переходять через Яїк, і з-під Оренбурга хапають людей. Войски тутешні або переслідують Пугачова, або загороджують йому шлях, і на кіргізцев йти мені не льзя, хана і салтанів я б хотів закликати. Вони відповідали, що вони не можуть утримати кіргізцев, яких вся орда бунтує. Raquo; З упійманням Пугачова, напрямком у Башкирію звільнилися урядових військ, почався перехід башкирських старшин на бік уряду, багато з них приєдналися до каральних загонів. Після захоплення в полон Канзафар Усаев і Салават Юлаєв повстання в Башкирії пішло на спад. Свій останній бій Салават Юлаєв дав 20 го листопада під обложеним їм Катав-Ивановским заводом і після поразки полонений 25 листопада. Але окремі повстанські загони в Башкирії продовжували опір до літа 1 775.
До літа 1775 тривали заворушення у Воронезькій губернії, в Тамбовському повіті і по річках Хопра і Вороні. Хоча діяли загони були невеликими і ніякої координації спільних дій не було, за словами очевидця майора Сверчкова, багато поміщики, оставя свої доми та економії, від'їжджають у віддалені місця, а залишається в будинках рятують життя від загрозливої ??загибелі, ночують по лісах raquo ;. Перелякані поміщики заявляли, що якщо Воронежская губернська канцелярія не прискорить винищенням тих злочинницьких опинилися зграй, то неминуче таке ж кровопролиття послідує як і в минулий заколот відбувалося .
Щоб збити хвилю заколотів, каральні загони почали масові страти. У кожному селі, в кожному містечку, що брав Пугачова, на шибениці і глаголи raquo ;, з яких ледь встигли зняти повішених самозванцем офіцерів, поміщиків, суддівських, стали вішати ватажків бунтів і призначених пугачовців міських голів та отаманів місцевих загонів. Для посилення страхітливого ефекту шибениці встановлювалися на плоти і пускалися по головним річках повстання. У травні в Оренбурзі відбулася страта Хлопуши: його голову на жердині встановили в центрі міста. При проведенні слідства застосовувався весь середньовічний набір випробуваних засобів. За жорстокостіі кількістю жертв Пугачов і уряд не поступилися один одному.
У листопаді всі...