пізно ...
Співчувати Йосипу в 1649-1650 рр.. Никона заважало не лише зарозумілість, але і грізні події в єпархії. Повсталі громадяни колодою вибили ворота Софійського будинку, в якому Никон сховав воєводу і тих дяків і стрілецьких голів, що зуміли бігти під захист митрополита. Решта були вбиті або кинуті в катівні разом з німцями, скуповують за указом боярина Б.І. Морозова хліб, м'ясо і рибу в голодний час. Никон, піднявши руки, намагався зупинити народ, і впав під ударами каменів і дубин як "найбільш заступник ізменнічей і ухранітель". Благочинні громадяни захистили що впав, а зляканий злочином народ розсіявся, що не розгромивши митрополичих покоїв, де був прихований воєвода.
Прокинувшись, Никон наказав телефонувати у великий дзвін Святої Софії, зібрати всіх архімандритів і ігуменів Великого Новгорода. З іконами і хрестами духовенство рушило по мосту на Торгову бік. Народ пропустив їх до собору Знамення Богородиці і дозволив зробити літургію, після якої поранений Никон на санях поїхав на Ярославово дворище, де вирувало народне зібрання. "Якщо зрите в мені яку провину або неправду до царя чи Російської царству, то мені сказавши, убийте мене! "Підбурники не підняли на нього руку, натовп почав розходитися. Никон велів відвезти себе в Софійський собор і поіменно прокляв головних бунтівників. Але це не зупинило новгородців. Надіславши царю Олексію Михайловичу чолобитну про очищенні держави Російського від зрадників, вони звільнили з темниці прикутого ланцюгом за шию митрополичого дворецького Івана Жиглова і обрали його воєводою, надавши на допомогу інших обраних начальників.
Поблизу Новгорода поставили варту, слугам митрополита небезпечно було ходити по місту, він відсиджувався на Софійському подвір'ї, але не припиняв боротьби з повстанням. Никон знайшов людину, здатну таємно доставити до Москви його послання, набув переговори з багатими і впливовими новгородцями, переконуючи заради порятунку міста схилити народ покаятися перед государем. Від Олексія Михайловича Никона були таємно доставлені дві грамоти. Одна містила похвали його діям, інша призначалася для оголошення народу перед земської хатою. Вона свідчила, що новгородці повинні просити у митрополита вибачення своїм великим прогріхи. Якщо митрополит простить, то й великого государя буде милість, інакше всі будуть смерті віддані.
Наступаюча на місто армія князя Івана Хованського змусила повсталих прислухатися до обіцянці Никона в разі покаяння домогтися у государя вибачення учасникам хвилювань. Церемонія покаяння була обставлена ​​пишно. Новгородці в Софійському соборі зі сльозами просили Никона про заступництво. Після тригодинного повчання митрополит відпустив їм гріхи і звільнив від прокляття. Новгород заспокоївся, хоча митрополит не думав про всепрощення. За його вказівками до підходу каральної армії без шуму були схоплені і заточені триста чоловік. Хованський набув місто і повідомив Никона, що рішення про покарання порушників ...