ціації та асоціації з інгібіторами серинових протеаз (антитромбін III та інші) описувалися за допомогою кінетики другого, першого і псевдопервого порядку відповідно. У всіх розрахунках, якщо не вказано протилежне, початкові концентрації активних факторів (окрім чинника VIIa) були рівні нулю, а концентрації неактивних попередників відповідали наведеним у Таблиці 1. p> Нижче наведені рівняння моделі, яка описує згортання в гомогенних системах очищених білків, які імітують плазму. Ці реконструйовані системи експериментально досліджувалися в роботах [43, 87, 88]. Результати цих досліджень були використані для послідовної побудови та верифікації моделі. p> Блок реакцій зовнішньої тенази
(9)
(10)
(11)
(12)
(13)
Активація факторів IX і X
(14)
(15)
(16)
(17)
(18)
(19)
(20)
Освіта тромбіну
(21)
(22)
(23)
Активація кофакторів, факторів VIII і V
(24)
(25)
(26)
(27)
Збірка мембранних комплексів
(28)
(29)
Шлях протеїну С
(30)
(31)
Антитромбін
(32)
Шлях TFPI
(33)
(34)
Якщо спеціально не обумовлено, кінетичні константи реакцій моделі відповідали Таблиці 2.
Таблиця 2. Кінетичні константи реакцій, що входять в модель гомогенної кінетики згортання. p> КонстантаЗначеніеRef.Блок реакцій зовнішньої тенази VIIa-TF, 1 нМ-1хв-1, 0.01 хв-1
= 0.01 нМсм. текст (розділ 3.1) [90] 0.1 нМ-1хв-1, 0.01 хв-1 * см. текст (розділ 3.1), 912 хв-1, 1200 нМ * [26], 3.66 хв-1, 2700 нМ * [26], 5 нМ-1 хв-1, 942 хв-1 * см. текст (розділ 3.1), 5 нМ-1 хв-1, 770 хв-1 * см. текст (розділ 3.1), 5 нМ-1 хв-1, 770 хв-1 * см. текст (розділ 3.1) Активація IX і X, 108 хв-1, 210 нМ *
.6 хв-1, 243 нМ
.1-108 хв-1, 16-82 нМ
хв-1, 22 нМ
хв-1, 210 нМ
хв-1, 254 нМ
[97]
[47]
[21]
[89]
[16], 435 хв-1, 238 нМ *
-186 хв-1, 230-542 нМ
хв-1, 205 нМ
хв-1, 550 нМ
хв-1, 238 нМ
[47]
[89]
[21]
[17], 0.79 хв-1, 10110 нМ *
.79 хв-1, 10110 нМ
.04734 хв-1, 1830 нМ
[70]
[84] 1740 хв-1, 4000 нМ *
хв-1, 190 нМ
хв-1, 83 нМ
[70]
[84] Освіта тромбіна4.1 хв-1, 1080нМ * [72] 7000 хв-1, 1000 нМ * см. текст (розділ 3.1) 2000 хв-1, 2000 нМ * см. текст (розділ 3.1) 5 нМ-1хв-1 * см. текст (розділ 3.1) Активація VIII і V54 хв-1, 147 нМ * [39] 54 хв-1, 147 нМ * см. текст (розділ 3.1) 0.31 хв-1 *
.31 хв-1
[63] 14 хв-1,...
