71.7 нМ *
хв-1, 71.7 нМ
= 0.216 хв-1нм-1
[57]
[81] 70 хв-1, 71.7 нМ *
= 1.08 хв-1нм-1см. текст (розділ 3.1)
[81] Збірка комплексів 100 нМ-1хв-1, 100 хв-1 *
> 100 нМ-1 хв-1
= 0.73 нМсм. текст (розділ 3.1)
[49]
[60] 100 нМ-1 хв-1, 100 хв-1 *
= 0.074-2.4 нМ
[62] Шлях протеїну C1.2 хв-1, 60000 нМ * [32] 1.2 хв-1, 60000 нМ * [32] 1.2 нМ-1 хв-1 * [80] Антітромбін0.00006 нМ-1хв- 1 * [44] 0.0003 нМ-1хв-1 * [31] 0.0004 нМ-1хв-1 * [41] 0.0004 нМ-1хв-1 * [78] Шлях TFPI, 0.44 нМ-1хв-1, 0 хв-1 *
.44 нМ-1хв-1, 0 хв-1
0.64 нМ-1хв-1
[18]
[42], 0.052 нМ-1хв-1, 0.02 хв-1 *
.052 нМ-1хв-1, 0.02 хв-1
0.96 нМ-1хв-1, 0.02 хв-1
[18]
[42] , 6 нМ -1 span> хв -1 , 0.02 хв -1 * см. текст (розділ 4.1) 20 нМ -1 хв -1 * см. текст (розділ 4.1)
У разі, коли наведено кілька різних значень констант, для моделі вибиралися значення, отримані в умовах, найбільш близьких до умов модельованих систем (людські білки, 37 С, pH 7.4, 150 мМ NaCl, 2 мМ CaCl2 , 200 мкМ фосфоліпідних везикул з фосфатидилхоліну і фосфатидилсерина у співвідношенні 3:1). Розглянемо більш детально механізми отделная реакцій моделі і вибір кінетичних констант цієї роботи. p align="justify"> Блок реакцій зовнішньої тенази
. Асоціація фактора VII (VIIa) і TF. p> Ми не змогли виявити в літературі кінетичних констант для асоціації фактора VII (VIIa) і TF. У ряді робіт вони були виміряні для розчинної TF, що не має трансмембранного домену, але відомо, що афінність зв'язування повнорозмірного TF і фактора VIIa відрізняється на кілька порядків від афінності розчинної TF [90]. Відомо також, що параметри зв'язування факторів VII і VIIa з TF приблизно однакові [12]. Тому в цій роботі константи асоціації фактора VII і TF вважалися рівними константам для VIIa, константа дисоціації була виражена через відоме значення рівноважної константи дисоціації Kd [90] і константи асоціації, а було знайдено за допомогою варіювання (Мал. 2). br/>В
Рис. 2. Активація 500 нМ фактора X додаванням 1.25 пМ TF і 100 пМ VIIa у присутності (?) І в відсутність (?) Фактора VII (10 нМ). br/>
Константа = 0.01 хв-1 була підібрана варіюванням за допомогою даного графіка. Решта константи відповідають Таблиці 2. Експериментальні дані взяті з роботи [85]. p align="justify"> 2. Реакції активації фактора VII. p> Фактор VII може активуватися факторами Xa, VIIa-TF, IXa і IIa [26]. При цьом...