оказано, що виділення сумарної РНК з клітин з використанням фірмового набору здійснюється простіше, швидше і з великим виходом, проте містить домішки ДНК і вимагає стадії обробки ДНКаза. Виділення РНК з використанням екстракції сумішшю фенол-хлороформ більше часу, витрат Турда і має менший вихід, проте призводить до отримання чистого продукту.
. Для оцінки біологічної дії антисмислових оліогуклеотідов обраний метод заснований на ПЛР. Був проведений вибір праймерів до кДНК гена EGFP виходячи з оцінки термодинамічних параметрів можливих структур, формованих ними в розчині і умов взаємодії з мішенню з наступним тестуванням їх в умовах експерименту. Для найбільш ефективної пари праймерів проведена оптимізація умов ПЛР та визначено оптимальні параметри.
Список літератури
олигонуклеотид клітина екстракція пірен
1.A.D. Branch (1996). A Hitchhiker s Guide to Antisense and Nonantisense Biochemical Pathways. Hepatology, 24: 1517-1529.
. U. Galderisi, A. Cascino, A. Giordano (1999). Antisense Oligonucleotides as Therapeutic Agents. J. Cell. Physiol, 181: 251-257
. M. Manoharan (2002). Oligonucleotide Conjugates as Potential Antisense Drugs with Improved Uptake, Biodistribution, Targeted Delivery, and Mechanism of Action. Antisense & nucleic acid drug development, 12:103-128
. I.M. Lagoja, P. Hedrdewijn (2007). Use of RNA in drug design. Expert Opin. Drug Discov. 2 (6): 889 - 903. p align="justify">. C.M. Roth, M.L. Yarmush (1999). Nuclear acid biotechnology. Annu. Rev. Biomed. Eng. 01:265-297
. Byong Hoon Yoo, Elena Bochkareva, Alexey Bochkarev, Tung-Chung Mou, Donald M. Gray (2004). 2 -O-methyl-modified phosphorothioate antisense oligonucleotides have reduced non-specific effects in vitro. Nucleic Acids Research, 32 (6): 2008 - 2016.
. Chrissy E. Prater, Paul S. Miller (2004). 3?-Methylphosphonate-Modified Oligo-2?-O-methylribonucleotides and Their Tat Peptide Conjugates: Uptake and Stability in Mouse Fibroblasts in Culture. Bioconjugate Chem., 15: 498? 507. p align="justify">. P.A. Morcos (2003). Morpholino oligos can block translation or nuclear processing of mRNA. Gene Tools, LLC. p align="justify">. F. E. Cotter (1997). Antisense therapy for lymphomas. Hematological Oncology, 15: 3-11
. C.A. Stein, R. Narayanan (1996). Antisense oligodeoxynucleotides: Internalization, compartmentalization and non-sequence specificity. Perspectives in Drug Discovery and Design, 4: 41 - 50. p align="justify">. B.R. Shaw, J. Madison, A. Sood, B.E. Spielvogel (1993). Oligonucleoside Boranophosphate (Borane Phosphonate). Methods in Molecular Biology, 20: 225 - 243. p ali...
