цепторні сайти), що змінює 5 -граніци нижележащего екзона.
5. Утримання інтрони
Некодуючі послідовність зберігається в транскрипті після процесингу. Якщо інтрон виявляється в межах кодує послідовності, то він може брати участь у кодуванні стоп-кодону або зрушувати рамку зчитування. Це може призвести до втрати функціональності білка. (Hadas Keren et al, 2010)
Крім описаних механізмів альтернативного сплайсингу існує ще два, завдяки яким різні мРНК можуть отримуватися з одного гена: множинні промотори і множинні сайти поліаденілювання. Транскрипція може починатися з різних точок. В результаті виникають транскрипти з різними екзонами на 5 - наприкінці (множинні промотори). Множинні сайти поліаденілювання, у свою чергу, забезпечують різні 3 - кінці для транскрипту. (Qun Pan et al, 2008)
Процес альтернативного сплайсингу
Сплайсинг здійснюється за допомогою сплайсосома. Її збірка починається з розпізнавання U1 5 - сайту сплайсингу. Після цього фактор сплайсингу 1 (SF1) зв'язується в точці розгалуження, утворюючи комплекс E. Потім велика субодиниця допоміжного фактора U2 (U2AF) утворює комплекс з поліпірімідіновой частиною, а його мала субодиниця зв'язується з 3 - термінальним AG-між Інтроном і Екзонно. Утворився комплекс є АТФ-незалежним комплексом E. Після заміни SF1 на U2 в точці розгалуження, комплекс Е перетворюється в АТФ-залежний комплекс А.
Подальшу освіту потрійного U4/U6-U5 комплексу призводить до формування комплексу В, який після конформаційних змін і перебудов перетворюється на каталітично активний комплекс С. (Hadas Keren et al, 2010) .занімает позицію U1. U1 і U4 видаляються з транскрипту. У що залишився комплексі здійснюється 2 реакції переетерифікації. У процесі першої реакції, 5 - кінець інтрони відщеплюється від попереднього екзона і приєднується до точки розгалуження через 2, 5 - фосфодіефірную зв'язок. У другій реакції переетерифікації, 3 - кінець інтрони відщеплюється від нижележащей кодує послідовності, і два екзона об'єднуються. Утворився інтрон вивільняється у формі Лариат і деградує. (Douglas L. Black, 2003)
2.3 Висока пластичність сплайсингу РНК
Ми ніколи не зможемо дізнатися, наскільки точно проходить сплайсинг в межах норми. У клітці існують механізми, які швидко знищують молекули РНК, у яких він пройшов з відхиленнями. Проте, порівняно з іншими кроками в експресії генів, сплайсинг незвичайно рухливий. Наприклад, мутація в нуклеотидної послідовності, критична для сплайсингу в певній точці, не обов'язково порушує його для всього інтрони. Замість цього вона зазвичай створює нову сплайс-модель. У більшості таких випадків випадає екзон. Іноді мутація створює нестандартні місця приєднання. Очевидно, механізм сплайсингу налаштований на вибір кращої з можливих моделей місця приєднання. У тому випадку, якщо оптимальна пошкоджена мутацією, буде обрана найкраща з наступних. Лабільність процесу сплайсингу РНК припускає, що вироблені випадковими мутаціями зміни є важливим шляхом еволюції генів і організмів.
Альтернативний сплайсинг дозволяє декільком типам білків виникати з одного гена. Деякі його приклади досить консервативні. Однак у більшості випадків клітина, таким чином, вибирає модель сплайсингу, щоб дозволити різним формам білка утворюватися в різних типах тканин і роздільно за часом. (Alberts B. et al, 2007)
2.4 Зв'язок канонічного сплайсингу і само-сплайсингу
Ймовірно, раніше клітини використовували РНК, а не білки в каталітичних реакціях і зберігали свою генетичну інформацію у формі РНК, а не ДНК. Доказом цьому є деякі дотепер збереглися механізми само-сплайсингу, який проходить за відсутності білків або інших молекул РНК. Прикладом можуть служити гени ядерної рРНК сучасного війкового Tetrahymena, T4-гени певних бактеріофагів і деякі гени хлоропластів і мітохондрій.
Інтрон само-сплайсингу може бути ідентифікований шляхом додавання чистої молекули РНК, що містить Некодуючі послідовність, і спостереження за реакцією. Таким чином, можуть бути виявлені 2 основних класу само-сплайсінгових інтронних послідовностей.
Інтрони першої групи починають реакцію сплайсингу з приєднання G-нуклеотиду до нуклеотидної послідовності. Він активується, щоб сформувати атакуючу групу, яка руйнує першу з фосфодіефірних зв'язків, створених у процесі зрощення (зв'язок перебуває на 5 - кінці).
У другій групі, особливо активний A-нуклеотид, що залишився в інтрони, є атакуючої групою, генеруючи, таким чином, проміжний Лариат. В іншому шляху реагування для обох типів інтронів однакові і є залишки досить древніх механізмів.
РНК інтрони згинається в о...
