идатки і перерахування цих коштів за призначенням , а отже, не могла ефективно контролювати дані операції.
Утретє державного контролю за надходженням і витрачанням коштів бюджетів різних рівнів, відсутність детального обліку цих коштів призвели до послаблення бюджетної дисципліни.
Крім того, в умовах гострої недостатності бюджетних коштів подібна організація виконання бюджетів усіх рівнів не дозволяла маневрувати фінансовими ресурсами для найбільш раціонального їх використання.
З метою проведення державної бюджетної політики, ефективного управління доходами і витратами в процесі виконання федерального бюджету Російської Федерації, підвищення оперативності у фінансуванні державних програм, посилення контролю за надходженням, цільовим і економним використанням державних коштів Указом Президента Російської Федерації від 8 грудня 1992 № +1556 «Про Федеральному казначействі» було введено казначейське виконання федерального бюджету. Для його здійснення у складі Мінфіну Росії було утворено Казначейство Росії. З цього моменту почалося відродження казначейства в Росії.
Процес формування і розвитку органів Казначейства Росії стикається з певними труднощами, які пояснювалися насамперед перерозподілом повноважень з управління бюджетними потоками, що зачіпало інтереси багатьох органів і структур:
за головними розпорядниками коштів федерального бюджету (міністерствами і відомствами) залишилося тільки право розподілу лімітів федерального бюджету по підвідомчим установам. З організацією казначейських органів вони втрачали можливість управляти фінансовими потоками за рахунками коштів бюджету;
безпосередні бюджетополучателі коштів потрапляли під жорсткий контроль за цільовим та ефективним витрачанням коштів федерального бюджету;
в комерційних банках повсюдно закривали рахунки по доходах і засобам федерального бюджету, на яких знаходилися значні грошові кошти, використовувані в обороті;
з'явилася можливість контролю термінів проходження грошових коштів федерального бюджету за рахунками в банкам;
органи виконавчої влади суб'єктів Російської Федерації, які отримують міжбюджетні трансферти, дотації, бюджетні кредити та інші кошти з федерального бюджету, втратили можливість одноосібного прийняття рішень про касовому витрачання коштів не у відповідності з їх призначеннями.
Таким чином, органи Казначейства Росії, представляючи інтереси держави, ставлять під контроль дії учасників процесу виконання федерального бюджету.
У середині 1999 року постановою Уряду Російської Федерації приймається Федеральна цільова програма розвитку органів федерального казначейства на 2000-2004 роки. Основною її метою є розвиток казначейської системи як найважливішого інструменту підвищення ефективності управління та контролю за державними фінансовими ресурсами.
Новий імпульс у розвитку Федеральне казначейство отримало у зв'язку з вступом у дію 1 січня 2000 Бюджетного кодексу Російської Федерації. Бюджетний Кодекс Російської Федерації вирішив такі основні завдання процесу виконання бюджетів Російської Федерації:
закріпив казначейське виконання бюджетів в Російській Федерації;
забезпечив необхідне відповідність касових видатків нормам, встановленим законом про бюджет на поточний фінансовий рік;
визначив, що обсяг прийнятих зобов'язань, оплата яких здійснюється за рахунок коштів бюджету, повинен відповідати обсягу доведених до бюджетополучателям лімітів бюджетних зобов'язань;
встановив відповідальність Головних розпорядників та одержувачів коштів федерального бюджету за цільове використання виділених їм коштів.
Протягом 2000-2002 років було завершено створення вертикальної структури органів федерального казначейства, що включає 89 управлінь федерального казначейства і 2 254 відділення федерального казначейства.
У 2002 році практично було завершено процес переведення всіх федеральних установ, за винятком окремих установ Міністерства оборони Російської Федерації, на обслуговування через органи федерального казначейства.
Операції з позабюджетних коштів федеральних установ також були взяті під контроль органів федерального казначейства. З 1 січня 2002 року рахунки з обліку позабюджетних коштів 33 тисяч федеральних установ відкриті в органах федерального казначейства.
Новим етапом у розвитку системи органів федерального казначейства стало проведення адміністративної реформи відповідно до Указу Президента Російської Федерації від 9 березня 2004 року № 314 «Про систему і структуру федеральних органів виконавчої влади».