ольсько-Литовської держави, були обіцяні вільне сповідання православної віри, використання російської мови в офіційних документах та інші права нарівні з католиками. Але наступні події показали, що католицьке уряд не мало наміру виконувати ці умови державної Люблінської унії, обмеживши і стиснуть православних в їх правах.
Це був час, коли після завершення Тридентского Собору (1545-1563 рр..) Римсько-Католицька Церква почала відходити від удару, завданого їй Реформацією, і відновлювати втрачені позиції. Найбільш діяльними в цьому відношенні були члени католицького ордена - «Товариства Ісуса», які були запрошені до Польщі в 1564 р., а в Литву - в 1569 р., коли було утворено Польсько-Литовська держава. Римсько-Католицької Церкви здавна прагнули схилити Росію до унії. Але після невдалої спроби впровадити унію в Московській державі після завершення Ферраро-Флорентійського Собору (1439) їх дії стали більш обережними.
У 1581 р. спроби поновилися: єзуїт Антоній Поссевіно, прибувши до Москви, домігся аудієнції у царя Івана Грозного, мав з ним богословський диспут і вручив йому твір «Про різницях між римським і грецьким віросповіданнями». Зусилля Поссевіна були марними, але після повернення в Рим він представив Папі звіт про свою діяльність. Пояснивши нездоланні труднощі, з якими пов'язані спроби введення католицтва в Росії, він звернув увагу Папи на південноросійську Церква в польсько-литовських володіннях, пропонуючи посилити католицький вплив саме в цих землях.
У 1589 р. в Росії було засновано патріаршество. Раніше автономія Київської митрополії зберігалася на основі тимчасового розриву і невизначених відносин між Москвою і Константинополем. Тепер між Церквами встановилися нормальні канонічні відносини і міг виникнути питання про возз'єднання розділених з Російською Церквою її частин.
І, тим не менш, на Варшавському сеймі (березень - травень 1596) питання про унію вперше був поставлений відкрито. Незабаром на сейм стали надходити офіційні протести земських послів (депутатів). Захисник Православ'я князь Костянтин Костянтинович Острозький особисто протестував проти самочинно введеної унії. У всіх протестах одностайно висловлювалася клопотання про позбавлення влади єпископів-уніатів. Єпископи Іпатій і Кирило звинувачувалися в тому, що вони таємно відправилися «в чужу землю і віддалися чужій владі».
Присутні в Бресті православні відкрили свій Собор незалежно від урядового уніатського Собору. Екзарх великий протосинкелом Никифор мав письмові повноваження від Патріарха Константинопольського головувати на місцевих Соборах, навіть якби в них брав участь митрополит Київський. Таким чином, присутність великого протосинкелом Никифора - Екзарха Константинопольського Патріарха, додало канонічно правильний характер православному Собору в Бресті.
Унія була відкинена православним Брестським Собором, відлучили уніатських єпископів і позбавили їх сану, повернувши в сан тих священнослужителів - захисників Православ'я, які були позбавлені його єпископами - прихильниками унії. На цьому Соборі були присутні багато мирян на чолі з князем К.К. Острозьким. Учасники православного Собору під головуванням Патріаршого Екзарха великого протосинкелом Никифора почали суд над митрополитом Михайлом (Рагоз) і єпископами-уніатами за те, що
. вони порушили єпископську клятву вірності ...