Ще однією не менш істотною і, бути може, більш складним завданням воєвод було підпорядкування сибірського війська місцевої адміністрації та изживание порядку козацького самоврядування і звичаїв, властивих козачому війську.
Нарешті, соціальні завдання ставилися перед воєводами і в політиці, що проводиться по відношенню до аборигенному населенню. Зокрема, в Сибірському наказі розуміли, що врахувати всі особливості управління Сибіром в наказах скрутно. Вся надавана влада воєводам обмежувалася, проте, рядом умов, лише частково відображених у наказах, і системою контролю над їх дотриманням. «Перш за все, уряд прагнув до того, щоб при управлінні сибірськими землями воєводи дотримувалися« государеву користь »без особистої користі». Місцеве населення на основі звичаїв володіло цілим рядом прав, використовуючи які могло істотно впливати на поточне управління: станові групи населення мали право звертатися до воєвод не тільки з різних проблем, а й з пропозиціями з управління, які, здавалося б, повністю ставилися до функцій воєвод . Більше того, населення володіло правом безпосередньо, хоча і з відома воєвод, звернення до вищої влади до Москви з проханнями: залишити воєводу на новий термін воєводства, змінити його до закінчення цього терміну і з скаргами, колективними та індивідуальними, на зловживання воєводської адміністрації. Воєводські зловживання можна звести до двох категорій: порушення безпосередніх державних інтересів і порушення інтересів різних верств населення, і їх світів. До типових зловживань ставилися збори невстановлених податків і мит, привласнення здаються селянами хлібних поставок, захоплення зерна, видавав служивим людям у вигляді платні, спекуляція таким зерном і винокуріння з продажем вина населенню, торгівля привезеними «з Русі» товарами, особливо з ясачнимі людьми.
«В результаті такої кадрової політики Сибірського наказу служба на воєводстві в Сибіру стала для деяких пологів спадковою. Наприкінці XVII в. на сибірських воєводствах побували 12 представників прізвища князів Гагаріних, по 11 представників прізвищ князів Барятінських і Волинських, 10 представників прізвищ князів Волконських, вісім представників прізвища Годунових ». Центральній владі було про що турбуватися, призначаючи до Сибіру воєвод і контролюючи їх діяльність. І разом з тим логіка історії змушувала її в XVII в., Зміцнюючи місцеву адміністрацію, спиратися на саме воєводське управління, яке їй виявлялося потрібніше, ніж станово-представницькі спільноти, що стежили за діяльністю воєвод. При цьому парадоксі за мирськими оставлялось право користуватися старовинним феодальним звичаєм - безпосередньо звертатися до Москви, до вищої інстанції зі своїми проханнями, потребами і скаргами. Мирські органи істинно використовували це право. Так позначався реальний політичний дуалізм сибірських світів. Але абсолютистської влада, все більш воплощавшаяся на місцях в персоні воєводи, послідовно прагнула до ліквідації такого дуалізму. Влада воєводського управління в XVII в. все більш міцнішала, причому це явище не було притаманне тільки Сибіру; відомо, що воно спостерігалося і в Центральній Росії. «Важливо відзначити, що колонізацію Сибіру російські самодержці розглядали не як узкофіскальную задачу, а як загальнодержавна справа. Безумовно, сибірська хутро надзвичайно високо цінувалася в той час і на внутрішньому, і на зовнішньому ринку. Однак переоцінювати її значення не слід. У XVII в...