боксу. Крім того, вони є мішенями для взаємодії з тканеспеціфічнимі транскрипційними факторами, в силу чого є необхідними для виборчої ініціації транскрипції з певних груп промоторів.
У дещо спрощеному вигляді сучасна модель збірки преініціаторного комплексу за участю загальних факторів транскрипції виглядає так: TFIID дізнається мінімальний промотор і, зв'язуючись з ним, позначає місце складання транскрипційного комплексу. TFIIA і TFIIB стабілізують взаємодія ТВР з ДНК, контактуючи одночасно з ДНК і ТВР. TFIIF забезпечує посадку РНК-полімерази II на формується комплекс. Далі до комплексу приєднуються TFIIE і TFIIH. Останній являє собою АТФ-залежну ДНК-ХЕЛІКАЗИ, яка забезпечує локальне плавлення ДНК в точці початку транскрипції.
Для збірки транскрипційного комплексу in vivo на більшості промоторів, крім загальних транскрипційних факторів потрібно цілий ряд додаткових білків. Регуляторні білки, що сприяють активації промотора, як правило, називають транскрипційними факторами. Вже зазначалося вище, що ці фактори можуть взаємодіяти з TAF-білками, беручи участь у визначенні місця посадки на ДНК фактора TFIID. Відомо дуже багато транскрипційних факторів. Деякі з них є універсальними, наприклад фактор Spl. Більшість характеризується певною специфічністю відносно типу тканини. Наприклад, в еритроїдних клітинах істотну роль в ініціації транскрипції глобінових генів грають транскрипційні фактори GATA - 1 і NF-E2.
Поряд з промоторами важливу роль у регуляції транскрипції еукаріотичних генів грають енхансери і сайленсери, які, відповідно, стимулюють і пригнічують активність промоторів. Так сталося, що першими були охарактеризовані енхансери різних вірусів (вірусу SV40, цитомегаловірусу і т. Д.). Ці енхансери не проявляють тканинної специфічності. Вони можуть працювати, перебуваючи на значній відстані від промотору та будучи розташовані в різних орієнтаціях. У геномі еукаріотичної клітини багато енхансери є тканеспеціфічнимі і можуть працювати тільки в тандемі з промотором певного класу. Механізм роботи енхансером/сайленсери поки ще не розкритий і залишається предметом дискусій. Відомо, що більшість енхансером містить ділянки зв'язування для різних транскрипційних факторів. Так, енхансер вірусу SV - 40 містить кілька ділянок зв'язування транскрипційного фактора Spl. Енхансери?- І?-глобінових генів містять ділянки зв'язування транскрипційних факторів GATA - 1 і NF-E2. У геномі дріжджів існують так звані UAS (upstream activating sequences), які відіграють важливу роль у процесі складання инициаторного комплексу РНК-полімерази II. Послідовності UAS розташовані на невеликій (менше 1 т. П. Н.) Відстані від промоторів. Вважається, що комплекс пов'язаних з UAS транскрипційних факторів прямо взаємодіє з TAF-білками, сприяючи утриманню TFIID на промоторі. При цьому невеликий фрагмент ДНК, що розділяє UAS і промотор, утворює петлю. На цій петлі можуть перебувати дві або три нуклеосомної глобули. Енхансери вищих еукаріот можуть розташовуватися на істотно більшій відстані від контрольованих ними генів (іноді ця відстань перевищує 100 т. П. Н.). Подібно UAS дріжджів, енхансери вищих еукаріот є місцями збірки тих чи інших активаторних комплексів. Саме з причини взаємодії з комплексом транскрипційних факторів активні енхансери виявляються розташовані у вільних від нуклеосом ділянках (ділянках гіперчутливості до ДНКаза I). Основне питання, яке виникає при спробі пояснити механізм дії еукаріотичних енхансером, полягає в тому, як Активаторний сигнал передається на значні відстані. У сучасній літературі обговорюється декілька моделей, що пояснюють передачу активаторного сигналу від енхансера до промотор (рис. 9). Всі ці моделі можна розділити на дві великі групи: моделі, засновані на процессівном поширенні активуючого сигналу (tracking), і моделі, засновані на безпосередній взаємодії енхансера і промотора з випетліваніем розділяє їх фрагмента (looping). Ясно, однак, що такий механізм не може діяти на дуже великих відстанях. Дійсно, між віддаленими енхансером і регульованими ними генами часто розташовуються гени, які даними енхансером Не активуються. Ацетилювання ж гістонів не володіє вибірковістю і має призвести до активації всіх генів, розташованих в гіперацетілірованном домені. Модель, що припускає пряму взаємодію енхансера і промотора (з випетліваніем розділяє їх фрагмента ДНК), цю проблему легко вирішує. В даний час отримані переконливі докази того, що віддалені енхансери (а точніше кажучи, пов'язані з енхансером регуляторні білки) прямо взаємодіють з промоторами, утворюючи складний Активаторний комплекс з транскрипційними факторами, локалізованими на промоторі. В англомовній літературі цей Активаторний комплекс називають chromatin hub. Сам факт взаємодії віддалених регуляторних елементів з контрольованими ними промоторами підтвердився в експериментах з вивчення тривимірної організації ДНК в ядрі. Використовуваний при ц...
