послідовностей клонованих провірусів, а також сайту їх інтеграції з хазяйської ДНК дозволив встановити як структуру провірусної ДНК, так і ті зміни, які відбуваються в клітинних послідовностях, прилеглих до місця інтеграції, в ході інфекції. Вірусна ДНК інтегрує із збереженням ДНК: LTR-gag-pol-env-LTR. Однак у клітинному геномі існує багато місць, в які може вбудуватися провірусної ДНК. Послідовності, в які він вбудовується, зазвичай не містять гомологий з вірусною ДНК. Більше того, у провірусів немає тенденції долучатися до вже існуючих в геномі послідовності ендогенних або екзогенних ретровірусів. Ці дані свідчать про те, що провірус може впровадитися в будь-яке місце хазяйської ДНК. p align="justify"> Фаза IV: експресія вірусної ДНК. У хронічно інфікованих клітинах вірусна РНК зчитується з інтегрованих провірусів. Вільна ДНК може експресуватися, але для збереження провируса необхідна його інтеграція. У клітинах, що містять кілька провірусів, зазвичай буває важко розібратися, який з них транскрибується. Різні клітини однієї популяції можуть істотно різнитися за рівнем експресії вірусу.
Провірус є транскрипционной одиницею з власними регуляторними послідовностями. Однак експресія конкретного провируса залежить як від вірус-специфічних, так і від хазяйських факторів, зокрема від місця інтеграції, фізіологічного стану клітини і LTR. На відміну від багатьох інших вірусів у ретровірусів продукти експресії, а експресія провируса залежить тільки від хазяйських ферментів. p align="justify"> Вірус-специфічна регуляція експресії здійснюється за допомогою LTR, несучих промоторів, енхансер транскрипції. Транскрипція починається на лівому кінці послідовності R лівого LTR. Як і більшість еукаріотичних генів, провіруси транскрибируются за допомогою клітинної РНК-полімерази II. p align="justify"> До складу LTR входять також елементи, що підсилюють транскрипцію (енхансери) і працюючі незалежно від свого становища і орієнтації. Відносна "сила" енхансера варіює залежно від виду тварини або стадії диференціювання клітин. p align="justify"> Первинним продуктом транскрипції провируса є повнорозмірна молекула РНК. Вірусна РНК звичайно становить від 0,1 до 1% тотакльной клітинної РНК. У повноцінних вірусів ця РНК, як і її процессірованной варіанти, виконують дві головні функції: формує віріони РНК і служить мРНК для синтезу продуктів генів gag, pol і env. Близько половини повнорозмірної РНК упаковується в віріони, решта служить мРНК. У клітинах зазвичай міститься дещо більше мРНК для gag, ніж для env, причому продукту гена gag синтезується приблизно в 20 разів більше, ніж продукту гена pol. Кожен з вірусних генів детермінує синтез поліпротеїну-попередника, який потім розрізається на два зрілих поліпептиду. p align="justify"> мРНК для продуктів гена env - результат сплайсингу повнорозмірної РНК, з якої вилучена велика частина послідовностей генів gag і pol. Одна з цікавих особливостей ц...
