У цій роботі була розглянута структура глобули сополимера, що складається з H та P ланок. Полярні ланки локалізовані в тонкому шарі на поверхні глобули через сильний відштовхування від гідрофобних. Поверхнева вільна енергія була розрахована в наближенні самоузгодженого поля, приймаючи в розрахунок ентропійний внесок полярних ланок, внесок їх взаємодії з гідрофобними ланками і конформаційну енергію гідрофобних блоків з кінцями, фіксованими на поверхні. p align="justify"> Інший приклад молекулярного дизайну послідовностей - це модель полімеру, що містить амфіфільні ланки, запропонована в недавній роботі В.В. Василевської з співавторами. Деякі приклади синтетичних полімерів з амфіфільних властивостями мономірних ланок - це полі (1-вінілмідазод), полі (N-ізопропілакріламід) та полі (2-етілакріловая кислота). Також багато біополімери (білки, полісахариди, фосфоліпіди) теж типові амфіфільні полімери. У більшості амфіфільних молекул кожна ланка має гідрофобною-гідрофільні властивості одночасно (рис. 3). p align="justify"> Модель амфіфільні сополимера представляє ланцюг з N мономерних ланок з гідрофобною основний ланцюгом і полярними бічними групами.
У розглянутій роботі представлені результати комп'ютерного експерименту, використаний метод молекулярної динаміки.
Рис. 4. Форм-фактори f x , f y , f z , для 256-звенной ланцюга в залежності від якості розчинника v, для двох значень v PH -виключеного об'єму ланок H і Р
Досліджуються різні конформації, в які переходить ланцюг, залежно від якості розчинника.
Результати експерименту виявилися несподіваними в тому сенсі, що полімер в щільному глобулярного стані показує невелике збільшення середньоквадратичного радіуса при погіршенні розчинника.
На графіках (рис. 4.) представлені відношення розмірів макромолекули по трьох осях до середньоквадратичного радіусу макромолекули - форм-фактори по трьох осях (f x < span align = "justify"> = R x /R, f y = R y /R, f z = R z /R). При деякому як розчинник розмір клубка по одній з осей різко зростає, що свідчить про зміну форми молекули. При низьких температурах форма стає циліндричної, з цим пов'язане збільшення R 2 .