H22, а інший - в районі з'єднання трьох спіралей РНК (рис. 2.2.3.). Ділянки відстають один від одного на один виток спіралі. В
ріс.2.2.3. Структура комплексу S15-16SрРНК (S15 T3C мутант)
Висновки:
1. Одержаний і оброблений набір дифракційних даних для комплексу S15-16SрРНК (S15 T3C мутант).
2. Методом молекулярного заміщення визначено структуру комплексу.
3. Показано, що рибосомну білок комплексу S15 зв'язується з 16S рРНК у двох просторово віддалених ділянках.
4. Показано, що мутація Т3С не змінює просторової структури комплексу і структури РНК-білкового інтерфейсу. br/>
Список літератури:
1. Серганов А.А. (1997) Вивчення РНК-зв'язуючих властивостей рибосомного білка S15 з Thermus thermophilus . Дисертація, МГУ. p> 2. Anston AA, Otridge J., Brzozowski AM, Dodson EJ, Dodson GG, Wilson KS, Smith T.M., Yang M., Kurecki T., Gollnick P. (1995). Biochemestry . 18 : 693-700
3. Argos P. & Rossmann M.G. (1980) in " Theory and Practice of Direct Methods in Crystallography " (Ladd and Palmer, eds.), Pp.361-417. Plenum, New York. p> 4. Bentley G.A. & Houndusse A. (1992), Acta Cryst. A48 , 312-322. p> 5. Blundell T.L. & Johnson L.N. (1974) Protein Crystallography. Academic Press, New York. p> 6. Brunger AT, Adams PD, Clore GM, DeLano WL, Gros P., Grosse-Kunstleve RW, Jiang J., Kuszewski J., Nilges M., Pannu NS, Read RJ, Rice LM, Simonson T., Warren G.L. (1998) Crystallography & NMR System: A New Software Suite for Macromolecular Structure Determination. Acta Cryst. D54 , 909-921.
7. Brunger AT, Milburn MV, Tong L., de Vos AM, Jancarik J., Yamazumi Z., Nishimura S., Ohtsuka E., Kim S.-H. (1990), Proc. Natl. Acad. Sci. USA 87 , 4849-4853. p> 8. Burd C.G. Dreifuss G. (1994). Conserved structures and diversity of functions of RNA-binding proteins. Science 265 : 615-620
9. Bycroft M., Grunert S., Murzin A., Proctor M., Johnston D. (1995). NMR solution structure of a dsRNA binding domain from Drosophila staufen protein reveals homology to the N-terminal domain of ribosomal protein S5. EMBO J. 14 : 3563-3571
10. Bycroft M., Hubbard TJP, Proctor M., Freund SMV, Murzin A. (1997). The solution structure of the S1 RNA binding domain: a member of an ancient nucleic acid-binding fold. Cell 88 : 235-242
11. Castellano E., Oliva G., Navaza J. (1992), J. Appl. Cryst. 25 , 281. p> 12. Cate JH, Gooding AR, Podell E., Zhou K., Golden BL, Szewczak AA, Kundrot C.E., CechT.R., Doudna J.A. (1996). RNA tertiary structure mediation by adenosine platforms. Science 273 : 1696-1699
13. Chang G. & Lewis M. (1994), Acta Cryst. D50 , 667-674. p> 14. Chang G. & Lewis M. (1997) Molecular Replacement Using Genetic Algorithms. Acta Cryst. D53 , 279-289. p> 15. Crowther R.A. & Blow D.M. (1967), Acta Cryst. 23 , 544-548. p> 16. Crowther R.A. (1972) in "The Molecular Replacement Method", Int. Sci. Rev. No.13 (Rossmann M.G., ed.). Gordon & Breach, New York. p> 17. Draper D.E. (1995). Protein-RNA recognition. Annu. Rev. Biochem . 64 : 593-620
18. Draper D.E. (1996) Ribosomal protein-RNA interactions. In Ribosomal RNA: structure, evolution, processing and function in protein biosynthesis. Eds. Zimmermann R.A., Dahlberg A.E. Boca Raton, Florida, CRC Press, 171-198
19. Franklin C., Shi J.P., Shimmel P. (1992). Overlapping nucleotide determinante for specific aminocylation of RNA. Science . 225 : 1121-1125
20. Fujinaga M. & Read R.J. (1987), J. Appl. Cryst. 20 , 517-521. p> 21. Harada Y., Lifchitz A., Berthou J., Jolles P. (1981), Acta Cryst. A37 , 398-406. p> 22. Huber R. (1965), Acta Cryst. A19 , 353-356. p> 23. Kjems J., Egebjerg J., Christiansen J. (1998) Laboratory techniques in biochemistry and molecular biology. Elsevier, 237
24. Kim J.L., Nikolov D.B., Burley S.K. (1993). Co-crystal structure of TBP recognizing the minor groove of a TATA element. Nature 365 : 520-527
25. Kirkpatrick S., Gelatt C.D. Jr & Vecchi M.P. (1983), Science, 220 , 671-680. p> 26. Kissinger C.R., Gehlhaar D.K., Fogel D.B. (1999) Rapid automated molecular replacement by evolutionary search. Acta Cryst. D55 , 484-491.
27. Marino JP, Gregorian RS, Csankovski G., Grothers DM (1995). Ent helix formation between RNA hairpins with comple...
