по положенню sn-1, трансацілазную активність і активність, характерну для білка PAF-AH.
Білок iPLA2-VIB містить ліпазная мотив GVSTG, де серин-483 знаходиться в каталітичному центрі; ATP-зв'язуючий мотив; мотив сигналу локалізації в пероксисомах на С-кінці молекули. З-кінці молекул, включаючи ATP-зв'язуючий повтор і каталітичний ділянку, білків iPLA2-VIB і iPLA2-VIA подібні. Відмінності спостерігаються в N-кінці білка, де у білка iPLA2-VIB немає анкірінових мотивів, багато серинових і треонінових залишків, частина яких може фосфорилироваться протєїнкиназамі А і С. Також є п'ять ділянок Ser-Pro, які є мішенями для пролінових кіназ. Одна з цих послідовностей (PTSP, залишки 269-272) є сайтом фосфорилювання мітогенактівірованнимі протєїнкиназамі. Від іонів кальцію активність даної ізоформи не залежить. Наявність різних ділянок фосфорилювання у білків групи iPLA2-VI вказує, що роль білків iPLA2-VIA і iPLA2-VIB в клітинах може відрізнятися. Обидві кальційнезавісімие фосфоліпази (iPLA2-VIA і iPLA2-VIB) є мембранозв'язані білками.
2.3 Субстратна специфічність
Каталозі код дією ФЛА2 характеризується поверхневої, позиційної і стерическую специфічністю ферменту. Фосфоліпаза каталізує реакцію на поверхні розділу ліпід/вода. З одного боку, для більшості ліполітічсскнх ферментів, включаючи і ФЛА2, активність ферменту виявляється значно вище при існуванні субстратів у формі агрегатів (міцел, змішаних міцел, моношарів і бішарів), ніж при дії на водорозчинні субстрати в мономолекулярної формі.
З іншого боку - ФЛА2 не діє на ліпідні молекули в складі щільно упакованих і, отже, важкодоступних ліпідних агрегатів. Для створення поверхні розділу фаз в цих випадках зазвичай використовують детергенти (тритон х-100, дезоксихолат натрію). Доведено, що для оптимального прояви поверхневої специфічності ферменту необхідна наявність агрегованих субстратів з певною довжиною ацильної ланцюга.
З виявленням стерическую і позиційної специфічності ФЛА2, були сформульовані досить суворі мінімальні вимоги ферменту до субстрату: в положенні sn-2 гліцеринового залишку ліпід повинен містити складноефірний групу, а в положенні sn-з - фосфатну. Пізніше було показано, що залишок фосфорної кислоти може бути заміщений сульфоніевим: сульфоліпіди виявився хорошим субстратом ФЛА2, відповідні фосфолппіди, де зв'язок С-О-Р заміщена на зв'язок С-Р, також гідролізуються ферментом, але в меншому ступені. Тому мінімальні вимоги ферменту до субстрату в даний час зводять до того, щоб гліцерофосфоліпідів володів природного L-конфігурацією і мала складноефірний зв'язок в sn-2-положенні гліцерину, а також містив на відстані п'яти-шести атомів від карбоксильного вуглецю групу з сильними аніонними властивостями. Вважається, що фосфатна група повинна мати одну вільну кислотну функцію.
У фосфоліпідів з двома чутливими сложіоефірнимі зв'язками - діфосфатіділгліцеріне (кардіоліпінс) - гидролизоват...
