ту, написаний І.І. Шуваловим, «австрійський плану університетів» і зауваження до нього, представлені членами комісії, що в результаті вилилося в підготовку О.П. Козодавлевим «Плану установі в Росії університетів» 1787
Вдалими імператриці здалися університетські реформи, проведені в Австрії в рамках політики освіченого абсолютизму Марії Терезії та Йосипа II. Катерина II сприйняла австрійський досвід як щось, що можна безпосередньо і швидко застосувати в Росії. Саме з цим пов'язаний черговий її сплеск інтересу до університетських проектам в 1780-і рр.., Паралельний ходу реформ Йосипа II. З 1782 р в Росії діяла особлива Комісія про заснування народних училищ під головуванням колишнього фаворита Катерини, графа П.В. Завадовського, причому до складу Комісії Йосипом II спеціально був присланий свого роду «експерт» за австрійськими освітнім реформам, серб за походженням Ф.І. Янкович де Мірієво. У центрі діяльності Комісії спочатку знаходилося створення в Росії системи середніх шкіл - «народних училищ». Але указом від 29 січня 1786 сюди було передано і рішення «університетського питання»- Розробка нового законопроекту для відкриття університету в таких містах, як Псков, Чернігів і Пенза. У цьому ж указі визначалися і загальні рамки майбутньої реформи, подібні з австрійської, а саме підкреслювалося, що російські університети є частиною держави, і їх управління, «підпорядкованість, права і переваги погоджуючись з установами Державними».
Першим документом, який Комісія обговорювала на засіданні 10 лютого 1786 р., був проект Статуту Московського університету, підготовлений в 1783 Г.І. І. Шуваловим, який після повернення з-за кордону знову звернувся до університетських справах.
Саме існування Московського університету в кінці XVIII в. перебувало під загрозою через зміненого ставлення до нього з боку вищої влади. Вперше вона виникла на початку 1790-х рр.. через т. н. «Справи мартинистов». Хоча звинувачення тоді концентрувалися навколо Н.І. Новикова та очолюваної ним типографического компанії, але університет був безпосередньо зачеплений в них, оскільки поштовхом до розгортання діяльності Новикова, настільки стривожило влади, послужило відкриття в 1782 р. професором І.Г. Шварцем Приятельського вченого товариства при Московському університеті. Початок Французької революції лише посилило негативне ставлення влади до університету В підбурюванні до безладів тоді звинувачувалися не лише змовники-масони, а й учені, філософи взагалі. Гроза над Московським університетом, яка загрожує саме таким «кінцевим падінням», вибухнула в 1792 р. У лютому при перетині кордону Російської імперії в Ризі були заарештовані два студенти, М.І. Невзоров і В.Я. Колокольников, відправлені Московським університетом для продовження навчання за кордоном. Одночасно в Москві був арештований Новиков, і справа, таким чином, набувало характер викриття широкого «змови мартинистов».
Тому не дивно, що за царювання Павла I знову, як і в петровський час, в Росії енергійно почали затверджуватися принципи утилітаризму, що складали конкуренцію університетові, через що загроза його закриття (незважаючи на перегляд Павлом « справи мартинистов »і благовоління до Новикова) зберігалася. Новий імператор явно вважав за краще загальній освіті спеціальна, особливо військове. За науками, які не обіцяли практичного застосування, Павло не визнавав ніякої цінності, але, навпаки...