ча ця сфера віддавалася повністю під контроль лорд-протектора і Ради, Палата громад, в порушення конституції, втручалася в ці справи. Далекі від радикально индепендентских поглядів, Коммонер, бажаючи толерантності як до католиків в Англії, так і до протестантів в Іспанії, склали проект англо-іспанського союзу. При цьому вони, впливові купці, що прийняли в 1651 році Навігаційний акт і почали війну з Голландією, були занепокоєні кінцем цієї війни. Хоча, швидше, не самим закінченням війни, а, на їх думку, занадто легкими для Сполучених Провінцій умовами миру. Думка Кромвеля було діаметрально протилежно: головного суперника Англії він бачив в Іспанії, а головну зону розширення колоній - у Карибському морі. Тим більше, навіщо треба було укладати мир з Голландією і воювати з Іспанією, щоб потім зробити навпаки?
Однак, найважливішим конфліктом протектора і його Першого парламенту була боротьба за модифікацію системи управління. Колишні члени Довгого парламенту, повернувшись нарешті до Палати громад, не могли змиритися з тим, що тепер вони мають більш обмежені повноваження, ніж раніше. З перших днів роботи, парламент взявся за переробку «Знаряддя управління». Відчуваючи, що парламент стає все більш опозиційним і менш контрольованим, Кромвель вже 12 вересня звертається до Коммонер з промовою про основи державного устрою Англії. У ній він ставить свої основні тези з цього питання - суверенітет розділений між ним і Палатою; повноваження парламенту не безстрокова; свобода совісті (відповідь на утиски сектантів); спільне його і парламенту командування військом. Після промови лорд-протектор зажадав від коммонеров підписати присягу на вірність йому. Близько сотні навідріз відмовилися було примушено до складання депутатських повноважень. 14 вересня було 140 підписалися, 21-го числа вже 190. У Кромвеля виникла надія на поступове сходження нанівець опозиційності Палати.
Але вже з 26 вересня в парламенті слухалася все більше проектів з розширення його влади. Спочатку була проведена спроба продовжити мінімальну тривалість роботи парламенту з 5 до 6 місяців, але вона наштовхнулася на вето Кромвеля. Потім Була відхилена описана вище система призначення членів Держради - відтепер люди вступили в цю посаду не тільки повинні бути схвалені Палатою. У разі, якщо призначення відбувалося в перервах в роботі парламенту, новопризначений член ради міг позбутися посади, якщо новий парламент не затвердить його в перші 40 днів своєї роботи. Кромвель, в міру державної необхідності, намагався прийти до компромісу: на початку жовтня він погодився скоротити флот на 28 кораблів і організувати Комітет у справах релігії.
З середини листопада 1654 Палата громад взялася безпосередньо за редагування «Знаряддя управління» з урахуванням своїх проектів щодо його зміни. Робота за проектом була закінчена 20 січня 1655. Визнаючи верховне управління прерогативою протектора і Держради, парламентарії надали собі широкі законодавчі повноваження: будь-який прийнятий Палатою акт, що не підписаний протягом 20 днів протектором, автоматично вступає в силу. У нову редакцію конституції включили також більшість вищезгаданих проектів Палати (у тому числі управління армією за згодою парламенту). На цьому терпець Кромвеля вичерпалося. Йому ледь вистачало терпіння дочекатися закінчення п'ятимісячного строку, після якого він міг розпустити невгамовних коммонеров. Згадавши, що місячні місяці коротше сон...