align="justify"> Розглянемо найбільш істотні зміни, внесені в модель, що описує згортання в плазмі, в порівнянні з моделлю для реконструйованих систем.
Редукція мембранних комплексів
При редукції системи рівнянь (9-34) застосовувалися, головним чином, два прийоми. По-перше, концентрації ряду попередників, таких, як фактори IX, X, VII, протеїн С, мало змінюються за характерні часи згортання (менше 10% за годину), були покладені рівними констант. По-друге, були скорочені швидкі змінні, відповідні концентраціям фермент-субстратні і фермент-продуктних комплексів, таких, як Xa-VIIa-TF, а також комплексів внутрішньої тенази і протромбінази (кінетичні константи асоціації/дисоціації цих комплексів наведені в Таблиці 2). Важливо відзначити, що під час згортання концентрація компонентів останніх двох комплексів можуть значно перевищувати константи їх дисоціації. Наприклад, концентрація фактора X досягає 2-3 нМ [43], а фактора Va -10 нМ і більше [27] при K d = 1 нМ. У попередніх моделях при редукції комплексів тенази і протромбінази використовувалися формули
(63)
(У роботах [11, 94]) або
(64)
(у роботі [45]), де [АВ] - концентрація комплексу, а [А] і [В] - повні концентрації компонент комплексу. За вказаними вище причин такий підхід може бути не цілком коректним. Тому були використані володіють більш широким діапазоном застосовності формули [5]:
(65)
(66)
Константи і механізми реакції утворення тромбіну
Кінетика активації протромбіну на в плазмі відрізняється від кінетики очищених систем, хоча механізми цієї відмінності не цілком ясні [82]. На відміну від реакції в очищених системах (див. розділ 3.1), в плазмі ця реакція йде без утворення проміжного продукту мезотромбіна [82] і строго підпорядковується кінетиці Міхаеліса [83]. У недавньому дослідженні, однак, було показано, що при згортанні в цільної крові може спостерігатися накопичення іншого интермедиата реакції, претромбіна 2 [27]. Оскільки ця речовина не має каталітичної активністю, можна очікувати, що його наявність не змінить кінетику системи в цілому. Тому в даній роботі при моделюванні згортання в плазмі і цільної крові реакція вважалася проходить за механізмом Міхаеліса, а константи були взяті з експериментальних даних роботи [83]. p align="justify"> Реакція утворення фібрину
Для опису перетворення фібриногену в фібрин використовувалася константа, отримана в експериментальній роботі [38]. Оскільки концентрація фібриногену в плазмі має порядок константи Міхаеліса для цієї реакції (див. Таблиці 1 і 3), а продукт реакції, фібрин, пов'язує тромбін з тією ж афінністю, що і фібриноген, то всі вирази для реакцій за участю тромбіну змінилися, придбавши члени в знаменнику, що описую...
