Цвінглі і його прихильники формально відділилися від свого єпископа (Констанського) і утворили особливу громаду. Тоді єпископ звернувся до сейму з проханням припинити реформи. Сейм був проти церковних нововведень, але жителі Цюріха залишалися на стороні Цвінглі. У 1523 році в Цюріху відбулися два релігійних диспуту, на яких Ульріх Цвінглі захищав своє вчення в 67 тезах. Після другого диспуту, цюріхци висловилися за Реформацію. У 1524-1525 роках обідня була скасована, в богослужіння введений рідна мова, ікони з церкви винесені, монастирі звернені в школи та благодійні заклади.
Крім Цюріха, цвінгліева реформа була введена і в деяких інших кантонах Швейцарії, як, наприклад, у Базелі, Берні, Шафгаузене і інших. Але кантони Люцерн, Швіц, Урі та інші залишалися вірними Римської церкви, так як церковна реформа зачіпала їх політичні інтереси. Реформа проникла в південну Німеччину, прикордонну з кантонами, де говорили по-німецьки. Там швейцарським реформаторам довелося зустрітися з лютеранським рухом. Лютерани зберегли від старої віри деякі погляди і обряди, які швейцарці усунули. Але все ж з'єднання здавалося можливим. Лютер же висловився рішуче проти нього. У Марбурзі у нього відбулася суперечка з Цвінглі. Головне незгоду полягало в розумінні Таїнства Причастя. Цвінглі бачив у ньому просте спогад про Таємної Вечері. Він виганяв з богослужіння всяку обрядовість, а іконошанування вважав ідолопоклонством. Кожен залишився при своїй думці. Цвінгі зі сльозами переконував Лютера визнати братнє спілкування між сповіданнями, але той відмовився навідріз. Так почався розкол серед протестантів.
У Швейцарії розгоралася збройна ворожнеча між реформаторськими кантонами і католицькими (лісовими кантонами). Католицькі загони підійшли до Цюріху в 1531 році. Війська реформаторів, які не встигли підготуватися, були розбиті. Цвінглі, який перебував при військах як проповідника, був убитий. Католики його труп четвертували і спалили, чому відкрито радів Мартін Лютер.
Кальвінізм. Переобладнання церкви, розпочате Цвінглі, після його смерті призупинилося тільки в німецькій Швейцарії. У французькій же Швейцарії його справу продовжували інші працівники Реформації. Один з них, Вільгельм Фарель, в 1532 році з'явився в Женеві і мав такий успіх, що женевці в 1535 році виступили за Реформацію і почали вводити церковний устрій згідно з вченням Цвінглі. Остаточна ж організація нового релігійного суспільства в Швейцарии, трохи відмінного від лютеранства, належить Жану Кальвінові.
Кальвін, родом француз, народився в 1509 році, був людиною дуже здібним, але відрізнявся вкрай суворим і похмурим настроєм духу. Вивчивши в Парижі латинське богослов'я і ознайомившись там же з протестантськими думками, він розірвав зв'язки з Римською церквою і виступив у ролі реформатора. У 1536 році він, не наважуючись залишатися у Франції, прибув до Женеви, зійшовся з ФАРЕЛ і незабаром, незважаючи на свою молодість, став на чолі реформаторський партії. Він виділявся ясністю розуму, переконливістю мови, твердою волею і вмінням впливати на людей. Кальвін, розділяючи погляди Лютера і Цвінглі, приєднав до них і свої. Особливістю було вчення про Таїнство Євхаристії і, головним чином, вчення про приречення. Він написав працю «Повчання в християнській вірі», в якому намагався довести, що протестантизм не їсти збори випадкових і мінливих думок, а струнке сповідання і...