снов. Використовуються як молекулярні маркери у визначенні споріднення, приналежності до конкретної популяції, для дослідження гібридизації. Мікросателіти характеризуються високою швидкістю зміни послідовностей, зумовленої В«проковзуваннямВ» при реплікації ДНК та точковими мутаціями. Являють собою одну з різновидів сателітної ДНК. Мікросателітної послідовності невеликої довжини, звані короткими тандемними повторами (2-6 нуклеотидів, від. Англ. STR - short tandem repeats), використовуються при картуванні геномів в роботі з рідкісними видами. p align="justify"> мінісателіти - поворяющіеся фрагменти ДНК довжиною від 7 і більше нуклеотидів. Є одним з різновидів сателітної ДНК. Вони зустрічаються більш ніж в 1000 містах геному людини. Використовуються в якості ДНК-маркерів. Механізмами походження є "прослизання" при реплікації ДНК, точкові мутації і рекомбінація. Мінісателіти складаються з повторюваних ланцюжків, переважно з варіантів гуанін-цитозин, довжиною від 10 до 100 пар основ. p align="justify"> Теоретично ПЛР відкриває широкі можливості для ідентифікації тих чи інших генів і видів. Все досить просто. Шукаємо в геномі ділянку в якому знаходиться ген, підбираємо до цієї ділянки специфічну і пару праймерів, яка комплементарна тільки шуканого ділянці і вперед. Проводимо ПЛР і точно знаємо, чи є шуканий ген чи ні. Проблема полягає в тому, що для того щоб знайти шуканий ген, дізнатися його послідовність, потрібно дуже багато праці, часу, матеріалів, обладнання, а стало бути - грошей. p align="justify"> Методи, які використовують ПЛР, можуть мати різну ступінь специфічності. Деякі методики не вимагають знання послідовності ДНК, а так як сиквенс (зчитування послідовності) цікавить ділянки досить доріг і вимагає хорошого дорогого устаткування, ці методи все ще часто застосовуються на практиці. p align="justify"> До таких методів відноситься маркування по поліморфізму довжин продуктів ампліфікації.
RAPD маркери - маркери виходять в результаті випадкової ампліфікації ДНК (Williams et al, 1990).
ISSR маркери - маркери засновані на межмікросателітних послідовностях (Zietkiewicz et al, 1994).
AFLP маркери - маркери поліморфізму довжин ампліфікованих фрагментів ДНК (Vos et al., 1995).
AFLP - Amplified Fragment Length Polymorphism
AFLP аналіз - складний метод аналізу, що складається з декількох етапів. В аналізі використовується праймер з штучно доданої послідовністю. p align="justify"> 1. Геномна ДНК рестріціруется двома рестріктазами (EcoRI і MseI) з утворенням фрагментів з виступаючими 3 - кінцями.
2. Рестріцірованная геномна ДНК легується з адаптером, що містить В«липкіВ» кінці для даних рестрикційних сайтів.
. Далее проводяться дві послідовні ПЛР: У перші...